محمدرضا بختیاری زاده - دانشجوی دکتری ژنتیک و اصلاح دام پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران
منصور ابراهیمی - دانشیار گروه بیوانفورماتیک پژوهشکده سبز دانشگاه قم
اسماعیل ابراهیمی - استادیار بخش زراعت و اصلاح نباتات دانشکده کشاورزی دانشگاه شیراز

توالی های ساده تکراری (SSR) به عنوان عوامل تشخیص غیرمستقیم سرطان و به منظور آشکار کردن اساس ژنتیکی ایجاد تومورها و پیشرفت سرطان مورد استفاده قرار گرفته اند. در این مطالعه به منظور بررسی EST های حاوی SSR در بافت های نرمال و سرطانی ریه، کتابخانه های EST این دو بافت از سایت هاروارد دانلود و با نرم افزار SSRLocator، ءSSRهای موجود در ESTها مورد بررسی قرار گرفت. در بافت سرطانی 238 SSR از 227 EST بدست آمد به طوریکه در هر 26/5 kb یک SSR شناسایی شد. در بافت نرمال نیز 208 SSR در 189 EST شناسایی شد بطوریکه در هر 16/1 kb یک SSR وجود دارد. در بافت نرمال و سرطانی به ترتیب برای 184 و 154 EST پرایمر طراحی شد. در این مطالعه، اختلافات معناداری بین SSRها (ترای نوکلئوتید، تترانوکلئوتید و پنتا نوکلئوتید) در بافت نرمال و سرطانی یافت شد. همچنین تفاوت معناداری بین توزیع و نوع اسید آمینه های پیش بینی شده از SSRها بدست آمد. با توجه به نقش SSRهای با بیش از دو نوکلئوتید در سرطان و دیگر بیماری های وراثتی و اختلافات معنادار بدست آمده در دو بافت نرمال و سرطانی ریه در این مطالعه، میتوان ارتباط و نقش SSRها و سرطان ریه را گزارش کرد. به عبارتی نتایج مطالعه حاضر اختلاف بین نوع و توزیع SSRها در بافت نرمال و سرطانی را تایید می کند. در نتیجه EST-SSRها می توانند به عنوان یک کاندید مناسب جهت بررسی بیشتر سرطان ها بویژه سرطان ریه مورد توجه قرار گیرند.

میکروستلایت، سرطان ریه، EST