ارزیابی تنوع ژنتیکی بیوتیپ های بکرایی در جنوب استان کرمان با تعیین توالی بخشی از ژنوم کلروپلاستی

بکرایی یکی از پایه های غالب مرکبات است و عمدتا در نواحی کوهستانی جنوب استان کرمان مورد استفاده قرار می گیرد. تکثیر آن از طریق کشت بذر بوده و این امر سبب ایجاد تنوع چشمگیری در آن شده است. در این تحقیق به منظور بررسی تنوع ژنتیکی بیوتیپ های بکرایی، مناطق مختلفی شامل میجان، هیشین، دلفارد، زارین، نراب و جبالبارز جنوبی از توابع جنوب استان کرمان مورد بازدید و بصورت تصادفی تعداد 15نمونه از بیوتیپ های بکرایی که تا حدودی از نظر مورفولوژیکی متفاوت بودند نمونه برداری انجام و بلافاصله به آزمایشگاه منتقل و در فریزر نگهداری شدند. استخراج دی ان ای از برگ به روش ژانگ و همکاران (1998) انجام، کمیت و کیفیت دی ان ای استحصالی به روش الکتروفورز و اسپکتروفتومتری بررسی شد. واکنس زنجیره ای پلیمراز با استفاده از جفت آغازگرهای R55/F55 به منظور تکثیر بخشی از ژنوم کلروپلاستی انجام گرفت. در تمامی نمونه های مورد بررسی باندی به اندازه ی تقریبی 600 جفت باز تکثیر شد. قطعه دی ان ای تکثیر شده تعیین توالی شده وتعلق آنها به ژنوم کلروپلاستی با استفاده از نرم افزار BLAST و جستجو در NCBI بررسی و تعیین شد. تجزبه مقایسه ای توالی های بدست آمده با استفاده از نرم افزار BioEdit و ترسیم درخت فیلو ژنتیکی با کمک نرم افزار MEGA5 مورد مطالعه قرار گرفت نتایج نشان داد که تعیین توالی قطعه تکثیر شده از ژنوم کلروپلاستی به خوبی رابطه های فیلوژنتیکی را بین بیوتیپ های بکرایی مشخص می کند.

کلیدواژه ها:

بکرایی ، تنوع ژنتیکی ، ژنوم کلروپلاستی و جنوب کرمان