تعیین روابط فیلوژنی برخی ارقام مرکبات ایران با استفاده از نشانگرهای مولکولیITS
- سال انتشار: 1393
- محل انتشار: اولین همایش الکترونیکی یافته های نوین در محیط زیست و اکوسیستم های کشاورزی
- کد COI اختصاصی: AGROCONGRESS01_116
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 624
نویسندگان
باشگاه پژوهشگران جوان و نخبگان، واحد علوم و تحقیقات، دانشگاه آزاد اسلامی تهران، ایران
استادیار، دانشگاه آزاد اسلامی واحد علوم و تحقیقات تهران، ایران
استادیار، موسسه تحقیقات مرکبات کشور، رامسر، ایران
استادیار، دانشگاه آزاد اسلامی واحد علوم و تحقیقات تهران، ایران
چکیده
اطلاع از روابط فیلوژنتیک و تنوع ژنتیک در مرکبات جهت تشخیص روابط ژنتیکی، شناسایی ژرم پلاسم و ثبت ارقام جدید، امری مهم و ضروری می باشد. در کلکسیون های مرکبات کشور، تعدادی بیوتیپ وجود دارد که شناسایی آنها عمدتاً بر اساس صفات مرفولوژی بوده و تحقیقات ژنتیکی چندانی بر روی آنها انجام نشده است. با توجه به اینکه نشانگرهای ملکولی می توانند در تعیین روابط ژنتیکی مفید باشند، در این پژوهش جهت بررسی میزان تنوع و قرابت ژنتیکی 45 ژنوتیپ مرکبات شامل 33 ژنوتیپ ناشناخته بومی همراه با 12 رقم تجاری، از نشانگر ITS استفاده شد. ناحیه ITS هسته در ارقام مرکبات با استفاده از یک جفت پرایمر تکثیر شد. محصول PCR نمونه ها برای تعیین توالی به شرکت ژن فناوران فرستاده شدند. جهت مقایسه توالی های به دست آمده با توالی گونه های دیگر این جنس و نیز جنس های دیگر از توالی های موجود در Genbank استفاده گردید. داده ها با استفاده از روش ماکزیمم پارسیمونی به کمک نرم افزار PAUP4.0 و همچنین روش Bayesian به کمک نرم افزار MrBayes3.2 آنالیز شدند. موقعیت تمام ارقام مرکبات در خوشه های موجود در کلادوگرام حاصل از داده های ITS تا حدودی با ویژگی های مرفولوژی تاکسای اصلی مطابقت دارد. این پژوهش همچنین از بالنگ، پوملو و نارنگی به عنوان سه گونه اصلی مرکبات حمایت می کند به طوری که این گونه ها به عنوان منشأ سایر ارقام محسوب می شوند. تجزیه تنوع ژنتیک و تعیین روابط خویشاوندی در مرکبات، اطلاعات مفیدی را برای برنامه های به نژادی، انتخاب و حفظ ارقام فراهم می کند.کلیدواژه ها
ارقام مرکبات، روابط فیلوژنتیک، نشانگر ملکولیمقالات مرتبط جدید
- رویکرد اخیر صیادان در تنوع بخشی بهابزار صید گرگور به منظور استحصال آبزیان خلیج فارس (بندر بوشهر)
- نقش منابع طبیعی و محیط زیست در امنیت غذایی
- تهیه فرآورده های پروتئینی از آبزیان
- بررسی پیشرفت های اخیر در پژوهشهای بیوتکنولوژی مواد غذایی
- تغییرات شیمیایی رخ داده در طی فرآیند سرخ کردن در روغن زیاد بر اساس برخی محصولات واکنش
اطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.