بررسی ایمونوانفورماتیکی پروتئین تروپومیزین کنه بوافیلوس

زمینه مطالعه: کنه بوافیلوس سبب انتقال برخی از اجرام پاتوزن و کاهش تولید درگاو می شود. پروتئین تروپومیوزین، تنظیم گر فعالیت اکتین بوده و نقش مهمی در واکنش های ایمنی، الرژی و تهیه واکسن دارد. هدف: روش های مرسوم شناسایی دقیق شاخص های آنتی زنتیک (اپی توپ ها)، طاقت فرسا، زمان بر و پرهزینه است، لذا توجه ما در این مطالعه به سمت توسعه روش های سریع تر نظیر پیشگویی اپی توپ های احتمالی مورد شناسایی سلول B و +TCD4، مبتنی بر توالی و ساختار پروتئین می باشد. روش کار: از گسترده وسیعی از برنامه ها و ابزارهای ایمونوانفورماتیک جهت آنالیز آنتی ژنسیتی، فراوانی ساختار ثانویه پروتئین و دومن ها، فاکتورهای فیزیکوشیمیایی مرتبط با مکان اپی توپ های خطی، اپی توپ های سلول B، قطعات پپتیدی متصل شونده به آلل های MHC کلاس 2 گاو استفاده گردید. نتایج: آنالیز پروتئین با لگوریتم های مختلف و انتخاب اپی توپ های مورد توافق در بیشتر ابزارها منجر به به دست آمدن سه پپتید برگزیده با خاصیت اپی توپی برای سلول NH2-AMVEADLERAEERAETG-COOH)AA(170-185), (NH2-EQLSQANSKLEEKDKALQA-COOH)AA(62-80 و (NH2-VGNNLKSLEVSEEKALQKEET-COOH)AA(200-218) و یک پپتید برای سلول NH2-LEEELRVVGNNLKSL-COOH)AA(192-207) گردید. نتیجه گیری نهایی: جهت تحریک رضایت بخش سیست ایمنی تنها قطعاتی از پروتئین (اپی توپ ها) کافی می باشد. انتخاب اپی توپ های بهینه سبب تمرکز پاسخ ایمنی و تهیه واکسن مناسب شده و از پاسخ های آلرژیک و نامطلوب می کاهد.

کلیدواژه ها:

کنه بوافیلوس ، اپی توپه ها ، ایمونوانفورماتیک ، پروتئین تروپومیوزین