Multiple sequenc e alignment using biological features classification
- سال انتشار: 1393
- محل انتشار: اولین کنفرانس بین المللی مهندسی دانش،اطلاعات و نرم افزار
- کد COI اختصاصی: ICKIS01_035
- زبان مقاله: انگلیسی
- تعداد مشاهده: 787
نویسندگان
Imam Reza International University Mashhad, Iran
Faculty member of Islamic Azad university, Mashhad branch Mashhad, Iran
چکیده
Multiple biological sequences alignment like protein sequences or DNA/RNA in order to discover the functions, structures and evolutionary relationships among species andalso discovering drugs is a fundamental study in bioinformatics. Unfortunately the multiple sequence alignment is a NP-completeproblem and the reliability of the existing algorithms is not so high. The objective of our study was to improve multiple sequence alignment using biological features such as secondary structure of the sequences available in knowledge databases like SWISSPROT to achieve a more reliable alignment. We alsoprovide a new method for grouping the similar sequences using biological features. The results of our tests on these databasesindicate that the accuracy of the provided FCB MSA algorithm is much more than the existing alignment tools such as TCOFFEEand MAFFT.کلیدواژه ها
Bioinformatics, Clustering, Multiple sequence alignment, Scoring functionمقالات مرتبط جدید
- بررسی اجمالی اینترنت اشیاء و مشکلات امنیتی آن
- نقش فرماندهی و کنترل و سامانه های آن در نبرد های آینده
- نقش فناوری های بدون سرنشین در عملیات جنگ نوین
- نقش زیرساخت های نظامی سایبری در کنترل میدان جنگ (اقدامات الکترومغناطیسی سایبری)
- طراحی و شبیه سازی دروازه منطقی تمام نوری AND مبتنی بر بلور فوتونی با ابعاد کم و مناسب برای مدارهای مجتمع نوری
اطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.