The Improvement of Accuracy of Gene Expression Data classification with Gene Ontology

  • سال انتشار: 1393
  • محل انتشار: اولین کنفرانس بین المللی مهندسی دانش،اطلاعات و نرم افزار
  • کد COI اختصاصی: ICKIS01_030
  • زبان مقاله: انگلیسی
  • تعداد مشاهده: 884
دانلود فایل این مقاله

نویسندگان

Elnaz Qofrani

Imam Reza International University Mashhad, Iran

Mehrdad Jalali

faculty member of Islamic Azad university, Mashhad branch Mashhad, Iran

Mohamad Reza Kalani

the member of informatic educational group of medical sience of mashhad Mashhad, Iran

چکیده

Gene selection is one of important research issues in analysis of gene expression data classification. Current methods try to reduce genes by means of statistical calculations and haveused semantic similarity under gene ontology. In this article a technique has been presented based on which in addition toconsidering biological relation among genes, redundant genes by means of hierarchical clustering are omitted and the accuracy of classification increases. The structure and function of this technique have also been explained. The experiments using a single real data set indicate that the proposed technique in addition to selecting fewer genes, have higher accuracy of classification (Loocv), comparing to the technique that is based on semantic similarity

کلیدواژه ها

Ontology, Gene Selection, Semantic Similarity,Classification of Gene Expression Data

مقالات مرتبط جدید

اطلاعات بیشتر در مورد COI

COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.

کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.