جابر نصیری - دانشجوی دکتری، دانشگاه تهران، گروه زراعت و اصلاح نباتات، بخش ژنتیک مولکولی گیاهی
محمدرضا نقوی - دانشجوی دکتری، دانشگاه تهران، گروه زراعت و اصلاح نباتات، بخش ژنتیک مولکولی گیاهی
نفیسه منطقی - دانشجوی دکتری، دانشگاه تهران، گروه زراعت و اصلاح نباتات، بخش ژنتیک مولکولی گیاهی
سارا ناصری راد - دانشجوی دکتری، دانشگاه تهران، گروه زراعت و اصلاح نباتات، بخش ژنتیک مولکولی گیاهی

به منظور دستیابی به توالی های احتمالی مورد توافق (معروف به توالی های کزاک) واقع در 10 نوکلئوتید بالادست و پایین دست توالی شروع ترجمه TIS به ترتیب 286 و 228 توالی کدکننده پروتئینی با بیان بالا و پایین مربوط به ژنوم گندم مورد ارزیابی قرار گرفتند برمبنای مدل کاناور، بطور کلی، برای ژنهای با بیان بالا توالی مورد توافق cgccgCaGC(G/C)AUGGCG(a/g)g(G/C) gc(G/C)g و برای ژنهای با بیان پایین، توالی مورد توافق بدست آمد. در رابطه با جایگاه های 3-و+4 و+5 بازهایC و G ،G به ترتیب با مقادیر %52/86و71/72درصدو50/17درصددر مقایسه با سایر نوکلئوتیدها، بیشترین فراوانی را نشان دادند و بنابراین به ترتیب بصورتconsensus و consensus ،dominantنامگذاری شدند. علاوه براین، مشخص شد که جایگاه 5+، برخلاف جایگاه های 3- و 4+ در اکثر موارد با بازهای پیریمیدین (سیتوزین و تیمیدین) اشغال می شود. درضمن، با استفاده از نتایج بدست آمده از انواع الگوریتم های SVMیعنی SVM LibSVM و SVM PSO ،SVM Linear ،SVM Evolutionary ،SVM مشخص شد که این مدل ها بویژه دو الگوریتمSVM Linear و SVM توانایی قابل قبولی در رابطه با ایجاد تمایز بین توالی های با بیان بالا و پایین مربوط به ژنوم گندم دارا می باشند.

توالی مورد توافق ، Mrna ، الگوریتم هایSVM ، مکان شروع ترجمه، گندم نان