بررسی بیان ژنهای یونجه تحت تنش شوری با استفاده از تجزیه و تحلیل دادههای میکرواری

شوری در آب یا خاک، یکی از تنشهای مهم در نواحی خشک و نیمه خشک است. تنش شوری سبب تغییر در الگوی بیان ژنهای مربوط به گیاهان تحت تنش میشود. هدف از این پژوهش بررسی الگوی بیان ژنهای یونجه تحت تاثیر تنش شوری 180 میلی مولار نمک NaClدر بازهی زمانی0و6و24و48 ساعت بعد از اعمال تنش میباشد. به این ترتیب دادههای خام میکرواری تحت تاثیر شرایط تنش شوری از پایگاه دادهNCBIگرفته شد. جهت تعیین تفاوت معنیدار بیان ژنها بین شرایط کنترل و تنش از روشt-testدر نرم افزار Flexarryاستفاده گردید. نتایج حاصل از تجزیه و تحلیل نشان داد که به ترتیب بیان 2683و2799و4018 ژن در زمانهای 6و24 و 48 ساعت نسبت به کنترل افزایش بیان داشتند. همچنین بیان 2036 ژن در هر سه دوره زمانی افزایش داشت. برخی از این پروتئینهایشناسایی شده از جمله ریبونوکلئازها، گالاکتینول سنتاز و ترپن سنتاز در زمان اولیه 6 ساعت بعد از اعمال تنش دارای افزایش بیان بالا بود و بعضی مثل پروتئینهای اکسپانسین، گلوتاتیون، لیکانتو سیانیدین دهیدروژناز، پروتئین مرتبط با پاتوژنها و پروتئینهای حمل کنندهسولفات و دی کربوکسیلات در مدت زمان 24 و 48 ساعت پس از اعمال تنش بیشترین افزایش بیان را در گیاه نشان دادند. آنالیز کارکردیژنهایی که در هر سه دوره زمانی تحت تنش افزایش بیان داشتند، نشان داد که گروههای مربوط به پروتئین، متابولیسم ثانویه، متابولیسمهورمون RNAسیستمهای پیام رسانی و انتقال دهندهها در فرایندهای بیولوژیکی سلول، بیشتر تحت تنش شوری قرار میگیرند

کلیدواژه ها:

یونجه ، تنش شوری ، میکرواری