مقایسه الگوی بیان ژنهای ریشه یونجه آلوده به پاتوژنهای رودهای انسان توسط آنالیز دادههای ریزآرایه

هرساله گزارشهای متعددی مبنی بر شیوع بیماریهای ناشی از مصرف گیاهچههای لگومی که به پاتوژنهای باکتریایی روده انسان آلوده اند، همچون باکتریSalmonella enterica و Escherichia coli O157:H7ارائه میشود. این پاتوژنهای بیماریزای انسانی نه تنها در انسان سبب تغییر در الگوی بیان بسیاری از ژنهای مهم میگردند، بلکه الگوی بیان بسیاری از ژنهای درگیر در مسیرهای بیوسنتزی پروتئینهای کاربردی گیاه را نیز تحت تاثیر قرار میدهند. تحقیق حاضر که بر پایه آنالیزهای بیوانفورماتیکی دادههای ریزآرایه موجود در پایگاهNCBI استوار است، به بررسی میزان تغییر در الگوی بیان ژنهای یونجه مدل در زمان آلودگی به پاتوژنهای رودهای انسان میپردازد. نتایج حاصل از تجزیه و تحلیل دادهها با استفاده از نرم افزارهایFlexarry و Expression consolنشان داد که به ترتیب 994 و 968 ژن بعد از آلودگی یونجه با اشرشیاکلی و سالمونلا افزایش بیان معنیداری داشتند. از این تعداد 501 ژن به طور مشترک افزایش بیان معنیداری نشان دادند. بیشترین میزان افزایش بیان ژن در زمان آلودگی گیاه به باکتریهای اشرشیاکلی و سالمونلا مربوط به ژن لیپاز/ لیپواکسیژناز 1 و کمترین میزان بیان مربوط به ژن سیتوکرومP450نسبت به سایر ژنها بود.

کلیدواژه ها:

یونجه ، پاتوژنهای باکتریایی ، ریزآرایه