شناسایی ژنوتیپ های ویروس هپاتیت سی با استفاده ازالگوریتم پنجره لغزان ،خوشهبندی و پیشبینی
- سال انتشار: 1393
- محل انتشار: اولین کنگره بین المللی و سیزدهمین کنگره ژنتیک ایران
- کد COI اختصاصی: CIGS13_0956
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 780
نویسندگان
دانشجوی کارشناسی ارشد مهندسی فناوری اطلاعات،دانشکده فنی و مهندسی،دانشگاه قم
گروه پژوهشی بیوانفورماتیک و گروه زیست شناسی، دانشکده علوم پایه، دانشگاه قم
گروه پژوهشی بیوانفورماتیک و گروه زیست شناسی، دانشکده علوم پایه، دانشگاه قم
دانشجوی کارشناسی ارشد مهندسی کامپیوتر، دانشکده فنی و مهندسی، دانشگاه آزاد یزد
چکیده
هپاتیت سی نوعی عفونت است که عمدتاً کبد را تحت تأثیر قرار میدهد و یکی از مشکلات عمده بهداشتی در سطح جهان است. بنا به گزارش مرکز بهداشت جهانی، شیوع این بیماری در حدود 3درصد است و تقریباً صد و هفتاد میلیون نفر از جمعیت جهان به این وی روسآلودهاند. هپاتیت سی اغلب هیچ علامتی ندارد؛ اما عفونت مزمن موجب زخمشدن کبد میشود و پس از چند سال به سیروز کبد میانجامد.در بعضی موارد، افراد مبتلا به سیروز کبد همچنین دارای نارسایی کبد، سرطان کبد یا عروق بسیار متورم مری و معده هستند که این مورد آخر میتواند منجر به خونریزی تا حد مرگ شود. بررسی سطح سرمی آنزی های کبدی، بررسی سرولوژیک وجود آنتیبادی هپاتیت سی،بررسی مولکولی کیفی و کمی، تعیین ژنوتیپ ویروس، تکهبرداری از کبد و بررسی هیستولوژیک، راههای آزمایشگاه ی و با لینی مختلف یهستند که به تشخیص و تعیین نوع و میزان پیشرفت بیماری کمک میکنند. در این تحقیق با استفاده از الگوریتم پنجره لغزان بر روی ژنوتیپهای یک و دو ویروس هپاتیت سی و با استفاده از وزن دهی و خوشه بندی و پیش بینی مهمترین مشخصه های ژنومی متمایزکننده بر اساس محل تکرارهای سه تایی بین این دو ژنوتیپ را مورد بررسی قرار دادیم. . نتایج حاصله نشان داد که دو مدل خوشه بندی K-Medoids و K-Meansاعمال شده بر روی دیتابیسهای مختلف عملکرد یکسانی داشتند وهمچنین دریافتیم به وسیلهی روشهای پیش بینیNaive Bayse و Bayse Kernleاین مدلها می توانند با دقت بسیار بالا دو ژنوتیپ ویروس هپاتیت سی را شناسایی کنند.کلیدواژه ها
ویروس هپاتیت سی، تشخیص نوع ژنوتیپ، پنجره لغزان، خوشه بندی،پیشبینیمقالات مرتبط جدید
اطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.