تایید آزمایشگاهیmicroRNAهای نوین در یک ناحیه حذف ژنومی شایع3p26.3 در سرطان ریه

سرطان ریه از عوامل اصلی مرگ و میر در سراسر جهان است RNA ها microRNA(miRNA)های کوچک غیرکدکننده 20-24نوکلئوتیدی تک رشته ای هستند که فرآیندهای مهمی از جمله تکثیر، تمایز، آپوپتوز و تومورزایی را کنترل می کنند. موقعیت ژنومی miRNAها بیانگر استقرار بیشتر آنها در نواحی حذف و اضافه شایع در سرطان ها است. تاکنون بیش از 2500miRNAدر انسان کشف شده و تخمین زده می شود که این تعداد می تواند تا 50000 افزایش یابد. مطالعات مختلف نشان دادند که حذف بازوی کوتاه کروموزوم 3 در سرطان های ریوی شیوع بالایی دارد. از این رو این ناحیه به عنوان ناحیه هدف مورد مطالعات بیوانفورماتیکی دقیق تر برای شناساییmiRNAهای جدید در سرطان ریه قرار گرفت. نتایج بررسی ناحیه 3p26.3با نرم افزارSSC profilerنشان داد که نواحی حفاظت شده ای در این منطقه وجود دارند که پتانسیل تولید ساختارهای پیش سازmiRNAرا دارا می باشند. نرم افزارهای دیگری برای تایید صحت این ساختارهای ساقه -حلقه ای پیش بینی شده استفاده شد و در نهایت سه ساختار ساقه-حلقه ای برای مطالعات آزمایشگاهی مورد بررسی قرار گرفتند. پرایمرهای اختصاصی برای تکثیر این نواحی طراحی و این نواحی تکثیر، کلون و تعیین توالی شدند. برای شناسایی فرم پیش ساز و بالغmicroRNAهای پیش بینی شده وکتورهای نوترکیب در چند دودمان سلولی ترانسفکت شدند و فرم بالغmiRNAنهایتا کلون و تعیین توالی شد. با توجه به موقعیت مرتبط با سرطان ریه اینmiRNAها ، آنهامی توانند نقش بالقوه ای در مراحل ابتدایی و یا توسعه سرطان ریه داشته باشند

کلیدواژه ها:

سرطان ریه ، میکرو آر ان ای ، بیوانورماتیک ، 3P