بررسی ترجیح کدونی آیزوفرمهای مختلف ژن رمز کنندهMYC

به منظور مقایسه و بررسی ترجیح کدونی آیزوفرمهای مختلف ژن رمز کنندهMYCتوالی 11 آیزوفرم از موجودات مختلف مثلآرابیدوپسیس، انگور و قارچهای مختلف از پایگاه NCBIتهیه شد و توسط برنامهGENE INFINITYمورد تجزیه و تحلیل قرارگرفت. با استفاده از تجزیه کلاستر، میزان تشابه ترجیح کدنی ژنهای رمز کنندهMYCمشخص شد. نتایج نشان داد که آیزوفرمهای مختلف دارای کدون ترجیحی متفاوتی نسبت به هم بودند. برای اسید آمینههای دارای 6 کدون هیچ یک از کدونها با نوکلئوتیدGاغاز نشده بودند. در هیچ یک از اسید آمینههای دارای 4 کدون ، کدون ترجیح برای جایگاه اول نوکلئوتید ازT استفاده نشده بود تجزیه کلاستر آمینههای دارای یک کدون شامل تریپتوفانtreومتیونین met فقط ازG برای نوکلئوتیدانتهایی استفاده شده بود تجزیه کلاستر ترجیح کدونی برای این آیزوفرمها نشان داد که آیزوفرمهای شماره 2و3و4و5و6که ازmusculus myelocytomatosis oncogeneاستخراج شدند بیشترین تشابه ترجیح کدونی را نسبت به یکدیگر دارا هستند در حالیکه بقیه در گروههای جداگانه قرار گرفتند. بنابراین می توان نتیجه گرفت که بین این آیزوفرمها از نطر ترجیح کدونی تفاوت وجود دارد.

کلیدواژه ها:

ترجیح کدونی ، MYB ، آیزوفرم