بررسی ترجیح کدونی آیزوفرمهای مختلف ژن رمز کنندهMYC

سال انتشار: 1393
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 524

فایل این مقاله در 5 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

CIGS13_0469

تاریخ نمایه سازی: 7 بهمن 1393

چکیده مقاله:

به منظور مقایسه و بررسی ترجیح کدونی آیزوفرمهای مختلف ژن رمز کنندهMYCتوالی 11 آیزوفرم از موجودات مختلف مثلآرابیدوپسیس، انگور و قارچهای مختلف از پایگاه NCBIتهیه شد و توسط برنامهGENE INFINITYمورد تجزیه و تحلیل قرارگرفت. با استفاده از تجزیه کلاستر، میزان تشابه ترجیح کدنی ژنهای رمز کنندهMYCمشخص شد. نتایج نشان داد که آیزوفرمهای مختلف دارای کدون ترجیحی متفاوتی نسبت به هم بودند. برای اسید آمینههای دارای 6 کدون هیچ یک از کدونها با نوکلئوتیدGاغاز نشده بودند. در هیچ یک از اسید آمینههای دارای 4 کدون ، کدون ترجیح برای جایگاه اول نوکلئوتید ازT استفاده نشده بود تجزیه کلاستر آمینههای دارای یک کدون شامل تریپتوفانtreومتیونین met فقط ازG برای نوکلئوتیدانتهایی استفاده شده بود تجزیه کلاستر ترجیح کدونی برای این آیزوفرمها نشان داد که آیزوفرمهای شماره 2و3و4و5و6که ازmusculus myelocytomatosis oncogeneاستخراج شدند بیشترین تشابه ترجیح کدونی را نسبت به یکدیگر دارا هستند در حالیکه بقیه در گروههای جداگانه قرار گرفتند. بنابراین می توان نتیجه گرفت که بین این آیزوفرمها از نطر ترجیح کدونی تفاوت وجود دارد.

کلیدواژه ها:

نویسندگان

دنیا پوی

دانشجوی کارشناسی ارشد بیوتکنولوژی دانشگاه شیراز، پژوهشکده بیوتکنولوژی

علیرضا میرزایی

دانشجوی دکترای اصلاح نباتات دانشگاه اردبیل

محمود احمدی کردشولی

دانشجوی دکترای اصلاح نباتات دانشگاه شیراز

زهره حیدریان

استادیار دانشکده کشاورزی-دانشگاه شیراز