آنالیز ژن پروتئین پوششی جدایههای ویروس موزائیک هندوانه- 2 در استان خوزستان

  • سال انتشار: 1393
  • محل انتشار: اولین کنگره بین المللی و سیزدهمین کنگره ژنتیک ایران
  • کد COI اختصاصی: CIGS13_0374
  • زبان مقاله: فارسی
  • تعداد مشاهده: 809
دانلود فایل این مقاله

نویسندگان

مرضیه نعیمی فر

گروه بیماریشناسی گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه آزاد اسلامی واحد دامغان

رضا پوررحیم

بخش تحقیقات ویروسشناسی گیاهی، موسسه تحقیقات گیاه پزشکی کشور، تهران،

شیرین فرزادفر

بخش تحقیقات ویروسشناسی گیاهی، موسسه تحقیقات گیاه پزشکی کشور، تهران،

غفور زاده دباغ

مرکز تحقیقات کشاورزی و منابع طبیعی صفی آباد دزفول

چکیده

ویروسها از جمله عوامل موثر در کاهش تولید محصولات جالیزی از خانواده گیاهی کدوئیانCucurbitaceaeبوده و ویروس موزائیک هندوانه - 2Watermelon mosaic virus-2, WMV2یکی از شایعترین و مهمترین آنها میباشد. به منظور بررسی پراکنش و تعیین خصوصیاتWMV2 در استان خوزستان (از مناطق مهم کشت کدوئیان کشور)، در سالهای 91 و 92 طی بازدید از مزارع کدوئیان، تعداد 700 نمونه از این گیاهان و نیز برخی از علفهای هرز جمعآوری گردید. بررسی پراکنش این ویروس بروش الایزا نشان داد که8/8درصد از نمونههای کدوئیان جمعآوری شده به این ویروس آلوده بودند. بیشترین آلودگی در شهرستان شوش10/7 درصد) و پس از آن در اندیمشک9/3درصد) و دزفول8/4درصدردیابی گردید. ناحیه ژن پروتئین پوششی CP5جدایه WMV2 بااستفاده ازآغازگرهای اختصاصی تکثیر و منجر به تولید قطعهای به طول تقریبی 1100 جفتباز گردید. آنالیز تبارزایی توالی ژنCP41 جدایه ایرانی با 23 جدایه دیگر از بانک ژن نشان داد که سه جدایه کدوئیان خوزستان به همراه جدایههای اروپایی و بسیاری از جدایههای ایرانی درگروهI و دو جدایه علف هرزی در گروهII قرارگرفتند دو جدایه خوزستانی کدوئیانSh.c.r. و 3.25 D.k.r.2.18 دارای بیشترین نزدیکی با جدایههای ایرانی گزارش شده قبلی از استان خراسان بود و در یک شاخه قرار گرفتند در حالی که جدایه خوزستانی کدوئیان Sh.h.r.1.10بیشترین مشابهت را با جدایه ایرانی از استان فارس و دو جدایه ژاپنیWMV2 نشان داد و در یک شاخه جداگانه قرارگرفت. بیشترین مشابهت دو جدایه علف هرزی خوزستان در گروهII با یک جدایه اسپانیایی تعیین گردید. نتایج این تحقیق نشان دهنده وجود تنوع در بین جدایههایWMV2 در مزارع کدوئیان استان خوزستان میباشد که در انتخاب و تهیه ارقام مقاوم کدوئیان در برابرآْلودگی به این ویروس از اهمیت زیادی برخوردار است

کلیدواژه ها

پوتیویروس، تنوع ژنتیکی، فیلوژنی

مقالات مرتبط جدید

اطلاعات بیشتر در مورد COI

COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.

کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.