آنالیز مولکولی جدایه ایرانی ویروس وای سیبزمینی با استفاده از توالی کامل ژنومی
- سال انتشار: 1393
- محل انتشار: اولین کنگره بین المللی و سیزدهمین کنگره ژنتیک ایران
- کد COI اختصاصی: CIGS13_0373
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 755
نویسندگان
بخش تحقیقات ویروسهای گیاهی، موسسه تحقیقات گیاه پزشکی کشور، ص.پ. ۱۴۵۴-۱۹۳۹۵، تهران
بخش تحقیقات ویروسهای گیاهی، موسسه تحقیقات گیاه پزشکی کشور، ص.پ. ۱۴۵۴-۱۹۳۹۵، تهران
چکیده
ویروس وای سیبزمینیPVYاز خانوادهPotyviridaeو جنسPotyvirusیکی از مهمترین ویروسهای آلوده کننده گیاهان خانواده Solanaceaeمیباشد. در این بررسی توالی کامل یک جدایه ایرانی از نوع سویهPVYNجدا شده از سیبزمینی تعیین گردید. طول توالی کامل ژنوم این جدایه 9703 نوکلئوتید بود که شامل ژنهای مورد نظرCP و NIb ،NIa-pro ،VPg ،6K2 ،CI ،6K1 ،P3 ،Hc-pro ،P1 به ترتیب به طول 825 و،564 ،156 ،1902 ،156 ،1095 ،1395و732 و 801 نوکلئوتید بود. آنالیز تبارازیی نشان داد که جدایه ایرانی به همراه جدایههای اروپایی نوترکیب NTNدر تبار Nقرار گرفت. نتایج آنالیز نوترکیبی با استفاده از روشهای مختلف نشان دهنده وقوع نوترکیبی در ژنوم جدایه ایرانی بوده و این جدایه مشابه با ژنوم جدایههای اروپایی PVYNTN دارای والدینی از دو تبارPVYO و PVYNبود. نتایج بدست آمده با استفاده از نرمافزارSISCAN V2مورد تایید قرار گرفت. با استفاده از تعیین نسبت(ω) dN/dSمیزان فشار انتخابی موجوددر جمعیت PVY مورد مطالعه قرار گرفتکلیدواژه ها
فیلوژنی، نوترکیبی، تنوعمقالات مرتبط جدید
اطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.