جداسازی و شناسایی ژن nlpدر سویهStreptomyces sp. UTMC2101

  • سال انتشار: 1393
  • محل انتشار: اولین کنگره بین المللی و سیزدهمین کنگره ژنتیک ایران
  • کد COI اختصاصی: CIGS13_0350
  • زبان مقاله: فارسی
  • تعداد مشاهده: 746
دانلود فایل این مقاله

نویسندگان

ریحانه پاپیران

آزمایشگاه بیوتکنولوژی میکربی، بخش میکروبیولوژی، دانشکده زیست شناسی و قطب تبار زایی موجودات زنده، پردیس علوم، دانشگاه تهران، تهران،ایران

جواد حامدی

آزمایشگاه بیوتکنولوژی میکربی، بخش میکروبیولوژی، دانشکده زیست شناسی و قطب تبار زایی موجودات زنده، پردیس علوم، دانشگاه تهران، تهران،ایران-

حمید مقیمی

آزمایشگاه بیوتکنولوژی میکربی، بخش میکروبیولوژی، دانشکده زیست شناسی و قطب تبار زایی موجودات زنده، پردیس علوم، دانشگاه تهران، تهران،ایران-

چکیده

پروتئین های شبه (NLPs) Nepگروه جدیدی از فیتوتوکسین های فعال علیه علف های هرز دولپه ای هستند و حضور ژن های مولدNLPsدر گونه های مختلفی از میکروارگانیسم ها از جمله سویه های متعلق به جنسStreptomycesگزارش شده است. هدف از انجام این پژوهش به دست آوردن ژن های جدید از اکتینوباکترها بوده است. در اولین مرحله از این پژوهشDNAژنومی سویه Streptomyces p. UTMC 2101استخراج شده و برای واکنشPCR با پرایمرهای دژنره قادر به تکثیر قطعه میانی ژنnlpاستفاده شد. این پرایمرها با همترازی نواحی حفاظت شده ژن های nlpشناخته شده در اکتینومیست ها طراحی شدند. با بررسی توالی محصولPCR کلون شده در وکتورpUC19 تکثیرقطعه 378 نوکلئوتیدی تایید شد. سپسDNAژنومی با کیفیت بالا با آنزیم EcoRI هضم شده و توسط آنزیم T4 DNA ligaseحلقوی شد. محصول واکنش اتصال برایInverse PCRبه منظور سنتز نواحی بالادست و پایین دست قطعه ژنی به دست آمده استفاده شد. با آنالیزهای توالی بدست آمده، توالی کامل ژن nlpبا 828 نوکلئوتید با 69 % بازهایGCهمراه با کدون آغاز شناسایی شد. با بررسی توالی آمینواسیدی حاصل از این ژن، پروتئینی با 275 آمینواسید و وزن مولکولیKD29,858 پیشبینی شد. همچنین مشخص شد که دمینNPP1 در این سویه متعلق به تیپII میباشد.

کلیدواژه ها

ژنnlp ، فیتوتوکسین ، PCRمعکوس ، Streptomyces sp

اطلاعات بیشتر در مورد COI

COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.

کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.