مطالعه بیوانفورماتیکی ژنAPX1 در حبوبات

ژنومیکس علم جدیدی است که به کشف توالیها و مطالعه عملکرد آنها در ژنوم کامل یک موجود خاص میپردازد. از انواع ژنومیکس،نوع مقایسهای است که ابزاری ارزشمند در گسترش منابع مولکولی برای گیاهان زراعی و شناسایی ژنهای کلیدی در توسعه این گیاهان ومطالعه تکامل خانوادههای ژنی است. پیشرفتهای فوقالعاده در فناوری توالییابی، راهی جدید به ژنومیکس مقایسهای باز کرده و محققان را قادر به انجام مقایسات گسترده ژنومی ساخته است. در این پژوهش سعی در بررسی توالی نواحی ژنومی در لوکوس Apx1 با استفاده از سیستم نشانگریSTSدر گیاهان لوبیا، نخود و نخودفرنگی بود. پس از تکثیر قطعاتSTSتوالییابی آنها و بررسی نواحی حفاظت شده با استفاده از پایگاه اطلاعاتیNCBIو نرمافزارDNAStarو سپس مقایسه توالیهای خاص اطلاعات مفیدی به دست آمد. نتایج نشان داد که قطعات به دست آمده، علیرغم داشتن نواحی حفاظت شده مشترک با هم، اختلافاتی را در سطح نوکلئوتیدی داشتند که میتواند ناشی از عوامل مختلف از جمله وقوع جهشهای ژنتیکی در طی تکامل باشد. همچنین اختلافات درون جنسی بیش از اختلافات بینجنسی مشاهده شد که میتواند تأثیر آن بر میزان عملکرد ژن در گونههای مورد مطالعه در تحقیقات بعدی مورد بررسی قرار گیرد. براساس نتایج به دست آمده تمامی ارقام چه در مقایسات دو به دو و چه در مقایسات گروهی اختلافات قابل توجهی را نشان دادند

کلیدواژه ها:

ژنومیکس مقایسهای ، حفاظت ژنومی ، حبوبات ، ، نشانگرSTS