ردیابی مولکولی پوتیویروسهای آلوده کننده ی محصولات سبزی در استان خوزستان

جنس پوتیویروس، دومین جنس بزرگ شناخته شدهی ویروسی محسوب میشود. پوتیویروس ها بیماری های مهمی در محصولات مختلف جهان ایجاد مینمایند. طی فصل زراعی 91 و 92 ، به منظور تعیین پوتیویروسهای آلوده کننده ی سبزیجات و علف های هرز،بازدیدهایی از مناطق مختلف جغرافیایی استان خوزستان به عمل آمد و نمونههای علائمدار جمعآوری گردید. آلودگی نمونه ها به پوتیویروسها، توسط آزمون الایزای غیرمستقیم و به کمک آنتیبادی وسیعالطیف پوتیویروسها (بیوربا، سوئیس) بررسی شد. آلودگی پوتی ویروسی در نمونههای مثبت الایزا، توسط آزمونRT-PCRو به کمک آغازگرهای عمومی از قبل توصیف شده ی5’-) NIb2F-TCIACIACIGTIGAIGGYTGNCC-3’) NIb3R و (GTITGYGTIGAYGAYTTYAAYAA-3’5 تأیید گردید. توالی نوکلئوتیدی قطعهی دی.ان.ای تکثیر شده به طول 350 جفتباز از ژنوم ویروسی در 14 جدایه تعیین و به کمک آنالیزBLASTبا سایر توالی های موجود در بانک ژن مقایسه شد. آنالیز تبارزایی با استفاده از الگوریتمmaximum-likelihoodانجام شد و برای تأیید نتایج جستجوی پایگاه دادهها مورد استفاده قرار گرفت. آلودگی پوتیویروسی در 13 نمونه، به طور قطعی و در سطح گونه شناسایی گردید (همسانی نوکلئوتیدی بیش از % 95 ). این ویروسها شامل ویروس موزئیک معمولی لوبیا، ویروس موزائیک زرد لوبیا، ویروس موزائیک کاهو و ویروس وایسیبزمینی بودند. در نمونهیKz-W331 به دست آمده از گیاهMalva neglecta در شهر شوشترنیز آلودگی پوتیویروسی ردیابی شد توالی نوکلئوتیدی و آمینواسیدی این جدایه، دارای بیشترین همسانی با ویروس رگ روشنی پنیرک FJ56 1293 و ویروس موزائیک سرخابAFP66237 بود، به ترتیب 88 و 86 درصد. نتایج حاصله نشان دهندهی وقوع احتمالی یک گونه یا سویهی جدید ویروسی درایران است. در این بررسی، آلودگی گیاهM. neglectaبه یک پوتیویروس برای اولین بار در کشور گزارش میشود

کلیدواژه ها:

پوتیویروسها ، خوزستان ، ردیابی ، آغازگرهای عمومی