بررسی ویژگی های بیوانفورماتیکی ژن IGF-1 در فیل ماهی (Huso huso)

سال انتشار: 1393
محل انتشار: دومین همایش ملی گیاهان دارویی و کشاورزی پایدار
کد COI اختصاصی: MPSA02_428
زبان مقاله: فارسی
تعداد مشاهده: 875

دانلود فایل این مقاله

نویسندگان

زهرا زین الدینی میمند

دانشجوی ارشد شیلات - دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری

سکینه یگانه

استادیار گروه علوم شیلات دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری

قدرت رحیمی میانجی

استاد گروه علوم دام دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری

ایوب فرهادی

استادیار گروه علوم دام دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری

چکیده

در این مطالعه ژن کد کننده پروتئین فاکتور رشد شبه انسولین فیل ماهی با توجه به اهمیت این پروتئین از طریق پایگاه های داده و نرم افزارهای بیوافورماتیکی مورد بررسی قرار گرفت. بدین منظور آنالیزهای بیوانفورماتیکی مختلفی شامل آنالیز همترازی ،ترسیم درخت فبلوژنی، خصوصیات بیوشیمیایی پروتئین و پیش بینی ساختار دوم و سوم پروتئین صورت گرفت. بررسی توالی پروتئینی این هورمون نشان داد که این پروتئین 178 اسید آمینه دارد. نقطه ایزوالکتریک این پروتئین 9/43 و وزن مولکولی 19914 می باشد. همترازی گونه های خاویاری snip هایی در بعضی نقاط این ژن در بین گروه های مختلف خاویاری نشان داد. ترسیم درخت فیلوژنی نشان داد که گونه Acipenser baerii از نظر تکاملی به این گونه نزدیک تر می باشد. نتایج این پژوهش یک پایه اطلاعات بیوانفورماتیکی را در ارتباط با شناخت هرچه بیشتر ژن IGF-1 با توجه به نقش مهم آن در گونه های مختلف را تهیه نمود.

کلیدواژه ها

فاکتور رشد شبه انسولین، پایگاه های داده، درخت فبلوژنی، همترازی، نفطه ایزوالکتریک

مقالات مرتبط جدید

اطلاعات بیشتر در مورد COI

COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.

کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.