فیلوژنی مولکولی سرده (Polygonaceae) Polygonum بر اساس ژن کلروپلاستی matK
- سال انتشار: 1391
- محل انتشار: چهارمین همایش بیوانفورماتیک ایران
- کد COI اختصاصی: IBIS04_165
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 686
نویسندگان
بخش علوم گیاهی دانشگاه تربیت مدرس
بخش علوم گیاهی دانشگاه تربیت مدرس تهران
بخش گیاهشناسی موسسه تحقیقات جنگلها و مراتع تهران
بخش گیاهشناسی موسسه تحقیقات جنگلها و مراتع
چکیده
در تیره علف هفت بند (Polygonaceae) سرده Polygonum (علف هفت بند) در زیر تیره Polygonoideae، قبیله Polygoneae قرار دارد. این سرده درایران دارای چهار بخشه می باشد. در این مطالعه 13 تاکسون شامل 72 گونه از سرده Polygonum و چهار گونه از سردهAtraphaxis (کاروان کش) بهعنوان برون گروه برای بازسازی روابط فیلوژنی مورد مطالعه قرار گرفتند. ژن کلروپلاستی matK با استفاده از واکنش زنجیر های پلیمراز تکثیر و همردیفسازی توالی ها توسط برنامه Muscle انجام شد. بازسازی روابط فیلوژنی با استفاده از روش های بیشینه صرفه جویی تعبیه شده در نرم افزارPAUP* ، روش آماری بایسین موجود در نرم افزار MrBayes و راکس ام ال صورت گرفت و حمایت شاخه ها بوسیله bootstrapping ارزیابی ش د. نتای ج حاصل ا زآنالی ز ژن کلروپلاستی matK نشان می دهد که گونههای Polygonum تشکیل چهار کلاد بزرگ دادهاند که ارزش حدود اطمینان بالایی دارند. P.botuliforme اولینشاخه است و با بقیه گونههایPolygonum رابطه خواهری دارد. P.polychnemoides ،P.afghanicum ،P.paranychioides و P.rottboellioides خویشاوندی نزدیکی دارند. رابطه خواهری گونه های (P.alpinum و P.lapathifolium) و( P.convolvulus و P.baldschuanicum) در کلاد چهارم، باارزش حدود اطمینان بسیار بالا (BP=100%) حمایت شده است.کلیدواژه ها
بایسین، راکس ام ال، علف هفت بند، فیلوژنیمقالات مرتبط جدید
اطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.