آشکار سازی توالی تنظیمی سیس و ترانس مستقر در نواحی غیر کد گذار ژن فاکتور 8 انسانی ، مبتنی بر آنالیزهای بیوانفورماتیکی
- سال انتشار: 1391
- محل انتشار: چهارمین همایش بیوانفورماتیک ایران
- کد COI اختصاصی: IBIS04_164
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 4229
نویسندگان
گروه سلولی و مولکولی پژوهشکده فناوری زیستی دانشگاه فردوسی مشهد
گروه زیست شناسی دانشکده علوم دانشگاه فردوسی مشهد
گروه سلولی و مولکولی پژوهشکده فناوری زیستی دانشگاه فردوسی مشهد
گروه زیست شناسی دانشکده علوم دانشگاه فردوسی مشهد
چکیده
تنظیم بیان ژن در سطوح مختلف، توسط مجموعه عناصری تنظیمی سیس و ترانس ،بویژه در نواحی غیر کدگذار یک ژن صورت می پذیرد. در این رابطه،موتیف های اتصال به فاکتورهای رونویسی (TFBs) و میکرو RNA ها ، توالی های تنظیمی توانمند با نقش های متعدد هستند، که به ترتیب به صورتسیس و ترانس و به طور معمول با عملکرد متضاد فعالیت می کنند. لذا با هدف آشکار سازی فراوانی ،نحوه پراکنش و نقش احتمالی توالی های فوق در طولنواحی غیر کد گذار، بویژه اینترون های ژن فاکتور 8 آنالیزهای بیوانفورماتیکی انجام ش د. نتایج حاصل از آنالیزها، منجربه آشکار سازی 2852 موتیف و13604 توالی با نقش احتمالی TFBs و میکرو RNA در طول هر 2 رشته از نواحی غیر کد گذار این ژن شد. در یک نگاه کلی، فراوانی موتیف ها و توالیهای آشکار شده رابطه خطی با طول توالی های غیر کد گذار نشان داد، با این وجود نوع این توالی ها، تراکم و الگوی پراکنش آنها در طول هر ناحیه نتایجمعناداری را نشان داد. برخلاف انتظار، با توجه به فراوانی توالی های تکرای در طول نواحی غیر کد گذار این ژن، اکثر موتیف های اتصال به فاکتورهایرونویسی در توالی های غیر تکراری و با فاصله معنا داری از نواحی اسپلایسنگ توالی های اینترون ها استقرار یافته اند که می تواند دلیلی بر نقش تنظیمیآنها در بیان ژن فاکتور 8 باشد. از سویی دیگر، تنها 7/2 درصد از توالی های شبه میکرو RNA بویژه آنهایی که متعلق به خانواده هایMmu ،Hsa و Bta می باشند دارای الگوی پراکنش و همولوژی معنی داری در طول این ژن بودند که به موجب آن اهداف آنها در طول ژنوم انسان، مبتنی بر آزمون بلاست، ونیز نقش احتمالی آنها در تنظیم بیان ژن فاکتور 8 مورد بررسی قرار گرفت. بر اساس داده های حاصل از این تحقیق، توالی های تنظیمی مستقر در طولنواحی غیر کد گذار ژن فاکتور 8 پراکنش هدفمند داشته که می توانند نقش تنظیمی سیس و ترانس ایفاء کنند، از سویی دیگر این نتایج ابزاری مناسب درارتباط با مطالعات تنظیمی بیان ژن فاکتور 8 را می تواند فراهم آورد.کلیدواژه ها
تنظیم بیان ژن، توالی های غیر کد گذار، موتیف های اتصال به فاکتورهای رونویسی، میکرو RNAمقالات مرتبط جدید
اطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.