سازی و بررسی ساختار پروتئین مرتبط با پاتوژن (PRپروتئین ها) در گیاه Hordeum vulgare L.

  • سال انتشار: 1391
  • محل انتشار: چهارمین همایش بیوانفورماتیک ایران
  • کد COI اختصاصی: IBIS04_158
  • زبان مقاله: فارسی
  • تعداد مشاهده: 959
دانلود فایل این مقاله

نویسندگان

بهمن پناهی

گروه بیوتکنولوژی گیاهی دانشگاه تبریز

وحید اصلان زاده

گروه بیوتکنولوژی گیاهی دانشگاه زنجان

عسگر پناهی

گروه زیست شناسی دانشگاه محقق اردبیلی

چکیده

پروتئین های مرتبط با پاتوژن (PRپروتئین ها) گروهی از مهمترین پروتئین هایی هستند که در گیاه در مواجه با پاتوژن ها القاء می شوند. در این تحقیق ساختار های اولیه و ثانویه این انتی پورتر مورد ارزیابی قرار گرفت و مشخص گردید که قسمت اعظم این آنتی پورتر بصورت هیدروفیل می باشد و ساختار ثانویه الفا هلیکس ساختار غالب در این پروتئین می باشد همچنین ساختار سه بعدی این پروتئین نیز با استفاده از نرم افزار مدلر ساخته شد و به منظور پالایش ساختار سه بعدی، تحت کاهش انرژی قرار گرفت. مدل ساخته شده همچنین به منظور ارزیابی کیفیت مدل با استفاده از نمودار راماچاندران و الگوریتم QMEAN مورد ارزیابی قرار گرفت نتایج حاکی از کیفیت بالای مدل ساخته شده بود.

کلیدواژه ها

پروتئین های مرتبط با پاتوژن، جو، ساختار سه بعدی.

مقالات مرتبط جدید

اطلاعات بیشتر در مورد COI

COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.

کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.