مطالعه و بررسی بیوانفورماتیکی استیل ترانسفرازی مخمر (AYT1)
- سال انتشار: 1391
- محل انتشار: چهارمین همایش بیوانفورماتیک ایران
- کد COI اختصاصی: IBIS04_059
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 588
نویسندگان
تهران، جلال آل احمد، پل نصر ،دانشگاه تربیت مدرس، دانشکده علوم زیستی، گروه ژنتیک مولکولی
کیلومتر ۷۱ اتوبان تهران- کرج، بلوار پژوهش، پژوهشگاه ملی مهندسی ژنتیک و زیست فناوری، بخش بیوتکنولوژی گیاهی
چکیده
بیماری فوزاریومی سنبله گندم(FHB) که بوسیله قارچ فوزاریوم گرامیناروم ایجاد می شود، یک بیماری مخرب گندم و جو محسوب می شود. این بیماری ازطریق کاهش کمیت و کیفیت محصول و آلودگی به تریکوتسین، باعث خسارات اقتصادی زیادی می شود. داکسی نیوالنول (DON)، تریکوتسین نوع B تولیدشده بوسیله فوزاریوم گرامیناروم، به عنوان فاکتور ویرولانس قارچ محسوب شده و در دوز پائین برای حیوانات بسیار سمی می باشد. محصولات غذائی آلوده به DON، خطر زیادی برای سلامتی انسان و دام دارند. این خطر می تواند بوسیله سمیت زدائی آنزیمی طی واکنش های گلیکوزیلاسیون، هیدرولیز سم،گلوتاتیناسیون و استیلاسیون کاهش یابد. مشخص شده که بیان بالای ژن مخمری استیل ترانسفراز (ScAYT1)، از طریق تبدیل DON به فرم استیله، منجربه مقاومت به DON می شود. در این مطالعه، ژن سنتزی کد کننده Ayt1 طراحی شد. آنالیز اولیه توالی، پیش بینی مکان درون سلولی، پیش بینی ساختارثانویه و نهائی، تعیین دومین، تعیین پایداری، اعتبار مدل های پیش بینی شده ، بهینه سازی کدون و بررسی ساختار ثانویه mRNA برایAYT1 بوسیله نرم افزارهای بیوانفورماتیک انجام شد. در مجموع، نتایج نشان می دهد که این ژن سنتزی، کاندیدای مناسبی جهت استیلاسیون تریکوتسین و در نتیجه مقاومت به FHB می باشد.کلیدواژه ها
AYT1، تریکوتسین، سمیت زدائیاطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.