طراحی کامپیوتری پپتیدهای حلقوی و خطی به عنوان مهارکننده رسپتورTrk b و نشان دادن تفاوت بین عملکرد باندشدن و کانفورمیشن آنها
- سال انتشار: 1391
- محل انتشار: چهارمین همایش بیوانفورماتیک ایران
- کد COI اختصاصی: IBIS04_056
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 645
نویسندگان
دانشجوی دکترای تخصصی بیوتکنولوژی پزشکی ،مرکز تحقیقات انیستیتو پاستور ایران و انیستیتو نانوتکنولوژی کارسروه در آلمان
دانشجوی کارشناسی ارشد بیوتکنولوژی پزشکی ،مرکز تحقیقات انیستیتو پاستور ایران و دانشگاه علوم پزشکی قزوین ،گروه بیوتکنولوژی پزشکی
چکیده
سرطان به عنوان دومین عامل مرگ ومیر در کل جهان میباشد ،که طبق آمار انجام شده در سال 2008 در حدود 31 درصد معادل 6/7 میلیون انسان در اثراین بیماری مهلک جان خود را از دست داده اند.روش های مختلفی برای درمان سرطان به کار گرفته شده که شامل جراحی و شیمی درمانی و مونو کلونالآنتی بادی و اخیرا پپتید درمانی می باشد ، که پپتید درمانی نسبت به موارد دیگر دارای مزایایی از قبیل سایز کوچکتر آنها ،سازگاری ساختاری بیشتر باپروتئین مورد نظر و همچنین توانایی ایجاد کردن اختلال بین اینترکشن های پروتئینی و دیگر اینکه عوارض جانبی کمتری نسبت به دیگر مو ارد نشان میدهند. رسپتورهایTrk[tropomyosin-receptor-kinase] به عنوان یک عامل انکوژن شناخته شده اند بنابراین هدف از این مطالعه طراحی کردنپپتیدهای حلقوی و خطی می باشد که این پپتیدها بر اساس توالی های منطقه سه در اعضای خانواده نئوتروفین ها که شاملBrain-Derived Neurotropic Factor (BDNF), Neurotrophin3(NT-3)Neurotrophin 4/5انتخاب شده اند .در این پروتکل در مرحله اول ، ساختار سه بعدیپپتیدهای مورد نظر با استفاده از روش molecular dynamicدر نرم افزار Hyperchem 7 ایجاد شده اند ، در مر حله بعدیDocking این پپتیدهایحلقوی و خطی با رسپتورهای Trk با استفاده از نرم افزار HADDOCKتکمیل شد ، در نهایت نتایج نشان داد که تفاوت قابل توجهی در عملکردباندینگو کانفورمیشن آنها بین این پپتیدها ی حلقوی و خطی وجود دارد.کلیدواژه ها
مقالات مرتبط جدید
اطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.