بررسی مهمترین کیناز های فسفریله کننده پروتئین تاو

آلزایمر بیماری است که سیستم عصبی مرکزی را در گیر می کند. (مغز) علائم این بیماری از دست دادن قدرت حفظ اطلاعات وبه سختی به یاد آوردن میباشد.یکی از مکانیسم های مورد توافق ایجاد آلزایمر جدا شدن پروتئین تاو از میکرتوبول های سلول های عصبی در اثر هایپرفسفریلاسیون می باشد.در این مطالعه جایگاه فسفریلاسیون را از تمام مقالات در آوردیم سپس ضمن انجام مدل سازی بر روی توالی های پروتئین تاو و دو پروتئین کینا ز گلیکوژن کیناز3 بتا و سیکلین وابسته به کیناز 5 که بر اساس مطالعات دیگران به عنوان مهمترین فسفریله کننده های تاو معرفی شدند تمامی اسید آمینه های فسفری له شونده در تاو توسط هر یک از آنزیم ها مشخص شدند و مهمترین آنها (برای گلیکوژن کیناز3 بتا سرین 396 و سرین 404 وبرای سیکلین وابسته به کیناز5 سرین 199 و سرین 202 ) مورد توافق در اکثر مقالات به منظور مطالعات داکینگ انتخاب شدند. مدل های مربوطه توسط سرور های سوییس مدل و آیتسر ارائه شدند زیرا هر یک از کیناز ها در پایگاه داده های پروتئین به صورت کمپیلکس وجود داشتند این مدل ها به دلیل ساخته شدن در شرایط خلا در جعبه های شبیه سازی دینامیک ملکولی ضمن استفاده از مدل مناسبی از آب به تعادل رسیدند. مدل نهایی به منظور بررسی میانکنش های الکتروستاتیک بین جایگاه های فعال کینازها و پروتئین تاو و بدست آوردن ثابت های اتصال از روش داکینگ استفاده شد. در پایان مشخص شد که تعدادی از اسید آمینه های مورد توافق جهت فسفریله شدن توسط کیناز های یاد شده به واسطه ی ثابت های اتصال قوی تری در جهت گیری تعیین شده با داکینگ از اهمیت بیشتری در فرایند هایپرفسفریله شدن و تجمع پروتئین تاو بازی می کنند