ارزیابی دقت نرم افزارهای پیش بینی کننده ساختارهای ساقه -حلقه شبه پیش سازهای microRNA در ژنوم انسان
- سال انتشار: 1391
- محل انتشار: چهارمین همایش بیوانفورماتیک ایران
- کد COI اختصاصی: IBIS04_039
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 830
نویسندگان
گروه ژنتیک مولکولی، دانشکده علوم زیستی، دانشگاه تربیت مدرس، تهران، ایران
گروه ژنتیک مولکولی، دانشکده علوم زیستی، دانشگاه تربیت مدرس، تهران، ایران
گروه ژنتیک مولکولی، دانشکده علوم زیستی، دانشگاه تربیت مدرس، تهران، ایران
گروه ژنتیک مولکولی، دانشکده علوم زیستی، دانشگاه تربیت مدرس، تهران، ایران
چکیده
این microRNAها، مولکول های RNA کوچک غیرکدکننده ای هستند که تنظیم بیان هزاران ژن در انسان را عهده دار هستند و در بسیاری از فرایندهایدخیل در بیماری و سلامتی نقش دارند. شناسایی این عوامل سلولی از اهمیت بالایی برخوردار است. نرم افزارهای زیادی برای پیش بینی وجودmicroRNA ها در انسان طراحی شده اند. علارغم اینکه این نرم افزارها در شناسایی این عوامل مؤثراند ولی میزان دقت و صحت آن ها در پیش بینی و شناساییmicroRNA های جدید متفاوت است. در این مطالعه به صورت تصادفی،05 مورد از توالی های پیش سازmicroRNA های انسانی موجود در سایتmiRBase انتخاب و با استفاده از نرم افزارهای پیش بینی کننده ساختارهای ساقه- حلقه شبه microRNA آنالیز شدند. نتیجه این آنالیز نشان داد که نرم افزار ssc- Profiler بیش از سایر نرم افزارها در شناسایی پیش سازهای واقعی microRNA ها در ژنوم توانمند است.کلیدواژه ها
نرم افزارهای بیوانفورماتیکی، پیش بینی ساختارهای miRNAاطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.