پیش بینی رفتار ویروس آنفلوانزا با استفاده از الگوریتمهای دنبالهکاوی
- سال انتشار: 1391
- محل انتشار: چهارمین همایش بیوانفورماتیک ایران
- کد COI اختصاصی: IBIS04_033
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 756
نویسندگان
دکترای بیوانفورماتیک، دانشگاه قم
کارشناسی ارشد مهندسی فناوری اطلاعات، دانشگاه قم
چکیده
آنفلوانزا یک بیماری واگیردار و خطرناک بوده که آمار مرگ و میر ناشی از آن به ویژه در کشورهای آمریکایی بسیار تکان دهنده است. یکی از را ه های پیشگیری از این تلفات گسترده، ساخت واکسن است. اما از آنجایی که این ویروس در اثر تغییرات فصلی یا تغییر محل با جهش مواجه میگردد، یعنی سویه آن تغییر میکند، بنابراین واکسنها خاصیت خود را از دست میدهند و غیرقابل استفاده میگردند. در اصل در اثر این جهش در نوع پروتئین هماگلوتینین یا نورامینداز این ویروس تغییر حاصل میگردد. هماگلوتینینها به 61 دسته طبقه بندی میشوند که کشف الگوهای تغییر بین این گروهها، هدف محققین برای ساخت واکسن بوده است. در این تحقیق ابتدا تکنیک دنبال هکاوی و انواع آن شرح داده میشود، سپس الگوریتم Fournier-Viger که تغیریافته روشprefixspan است و علت به کارگیری آن بر روی این پایگاه داده بیان خواهد شد. سپس نتایج حاصله و الگوهای استخراجی از این الگوریتم، با اعمال بر رویدادههای مربوط به کلیه سویه های ویروس آنفلوانزا در سطح جهان بدست خواهد آمد. لازم به ذکر است پایگاه داده مورد بررسی به صورت رکوردهایی ازشهرهای سراسر دنیا است و برای نتایج نهایی یک مقدار support به عنوان نسبت دنباله های دارای الگوی مورد نظر به کل دنباله ها، بدست آمده است.کلیدواژه ها
دنبالهکاوی، جهش، هماگلوتینین، آنفلوانزامقالات مرتبط جدید
اطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.