بهبود الگوریتم ژنتیک برای حل مسئله پیشبینی ساختار پروتئین

  • سال انتشار: 1393
  • محل انتشار: همایش ملی مهندسی رایانه و مدیریت فناوری اطلاعات
  • کد COI اختصاصی: CSITM01_287
  • زبان مقاله: فارسی
  • تعداد مشاهده: 1026
دانلود فایل این مقاله

نویسندگان

آرش مزیدی

دانشجوی کارشناسی ارشد مهندسی کامپیوتر، دانشگاه شیراز

نجمه سعید

دانشجوی کارشناسی ارشد مهندسی کامپیوتر، دانشگاه شیخ بهایی

نیلوفر مزیدی

دانشجوی کارشناسی ارشد مهندسی کامپیوتر، دانشگاه پیام نور علی آباد کتول

چکیده

بیوانفورماتیک علم نوینی است که در آن با استفاده از الگوریتم ها، نرم افزارهای کامپیوتری و بانکهای اطلاعاتی سعی می گردد تا بهمسائل بیولوژیکی، بخصوص در زمینه های سلولی و مولکولی پاسخ داده شود. پیش بینی ساختار پروتئین از جمله مسایل پیچیده ومهم علم بیوانفورماتیک است و تاکنون تحقیقات گستردهای برای حل این مساله با استفاده از الگوریتم های تکاملی از جملهالگوریتم ژنتیک صورت گرفته است. در این مقاله، به منظور افزایش دقت پیش بینی ساختار پروتئین، برای اولین بار از عملگرهمبری مبتنی بر ماسک الگو در الگوریتم ژنتیک استفاده شده است. نتایج حاصل از اجرای الگوریتم پیشنهادی ما بر روی پنجدنباله آزمون استاندارد (مورد استفاده در بسیاری از تحقیق های دیگر) نشان می دهند که استفاده از عملگر همبری مبتنی بر ماسکالگو در الگوریتم ژنتیک، می تواند به طور قابل توجهی دقت پیش بینی ساختار پروتئین را نسبت به الگوریتم های مشابه قبلی بهبودبخشد.

کلیدواژه ها

پیشبینی ساختار پروتئین، الگوریتم تکاملی، الگوریتم ژنتیک، مدل HP، عملگر همبری ماسک الگو

مقالات مرتبط جدید

اطلاعات بیشتر در مورد COI

COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.

کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.