تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیکی ژن های آنزیم IFS در گیاه سویا( Glycine max)

سال انتشار: 1392
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 710

فایل این مقاله در 5 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

NACONF01_1529

تاریخ نمایه سازی: 25 خرداد 1393

چکیده مقاله:

در این مطالعه، ژن آنزیم IFS با شناسه پروتئین ACN81824 از طریق پایگاه داده ها و ابزارهای بیوانفورماتیکی مورد بررسی قرار گرفت. ایزوفلاونوئیدها ترکیباتی هستند که عمدتاً در خانواده لگومینوزها از جمله سویا تجمع دارند. آنزیم های مسیر ایزوفلاونوئید عضوی از یک خانواده ژنی می باشند که در بررسی های انجام شده 5 آنزیم در این مسیر دخالت دارند که آنزیم های IFS و HIDH خاص ایزوفلاونوئیدها هستند. بررسی های انجام شده در پایگاه داده های NCBI وprotparam نشان داد که دو ژن IFS1 و IFS2 که بیان آنزیم IFS را بر عهده دارند بر روی کروموزوم شماره 7 و 13 قرار دارند. همچنین بررسی توالی پروتئینی این دو ژن نشان داد که ژن اول دارای 521 آمینواسید با وزن مولکولی58929/8 و ژن دوم نیز با 521 آمینواسید با وزن مولکولی 58741/7 می باشند. نتایج ححاصل از ProtScale نشان داد که پروتئین حاصل بیشتر آبدوست بوده و در بالای خط افقی نمودار واقع می شود. نتایج بلاست نشان می دهد که ژن IFS1 در سویا با ژن IFS2 در شبدر سفید 92% و ژن IFS1 در ماش و شبدر قرمز 85% انطباق دارند و همچنین ژن IFS1 در گیاهان دیگری همچون نخودفرنگی، یونجه و شبدر سفید نیز وجود دارد. نتایج قسمت درون غشایی این آنزیم نشان داد که اسید آمینه های 21-0 در ناحیه ترانس غشایی قرار دارند. همچنین هضم توالی پروتئینی با استفاده از آنزیم تریپسین 64 برش ایجاد کرد.

نویسندگان

فرزانه فاضلی

دانشجوی کارشناسی ارشد اصلاح نباتات دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری

حمید نجفی زرینی

استادیار دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Akashi T, Aoki T and Ayabe A. (2005) Molecular and ...
  • Bagnell C. (2005) Edited by W.B. Coleman and G.T. Tsongalis ...
  • Dhaubhadel S, Farhangkhoee M and Chapman R. (2008) Identification of ...
  • GuhaThakurt D. (2006) Computationsl identification of transcriptional regulatory elements in ...
  • نمایش کامل مراجع