کاربرد توالی یابی ژن 16SrRNA در بررسی ساختار ژنتیکی Paramysis intermedia در خلیج فارس و دریای عمان

سال انتشار: 1392
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 1,738

فایل این مقاله در 8 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

CFAAI02_051

تاریخ نمایه سازی: 27 اردیبهشت 1393

چکیده مقاله:

سخت پوست پارامایسیس اینترمدیا Paramysis intermedia یکی از مهمترین زئوپلانکتونهایی است که در نواحی مصبی و دریایی مورد تغذیه آبزیان قرار می گیرد. ارزیابی ژنتیکی جمعیت های این گونه به منظور حفظ ذخایر و همچنین تکثیر و پرورش این گونه غذای زنده ارزشمند ضروری است. در پژوهش حاضر برای اولین بار ساختار ژنتیکی سخت پوست پارامایسیس اینترمدیا در دو منطقه خلیج فارس و دریای عمان با استفاده از توالی یابی ژن میتوکندریایی 16SrRNAبررسی شد. تعداد نه هاپلوتیپ در دو منطقه بدست آمد و میزان تنوع هاپلوتیپی و تنوع نوکلئوتیدی برای تمامی نمونه ها بین دو منطقه به ترتیب 003/0 ± 978/0 و 000/0 ± 035/0 محاسبه شد. مقدار هتروزایگوسیتی مورد انتظار برای منطقه تیاب در خلیج فارس بیشتر (184/0 ± 287/0) از خلیج گواتر در دریای عمان (088/0 ± 014/0) بدست آمد. نتایج 10 نمونه توالی یابی شده شامل 365 باز همردیف شده ، 339 جایگاه ژنی مونومورف و 26 جایگاه ژنی پلی مورف نشان داد. مقدار Fst در سطح اطمینان 95/0 بین دو جمعیت 18/0 و معنی دار بود و در ترسیم درخت تکاملی این جدایی به وضوح دیده شد. بر اساس نتایج به دست آمده، سخت پوست پارامایسیس اینترمدیا در خلیج فارس و دریای عمان از تنوع ژنتیکی بالایی برخوردار است. همچنین جمعیت های این سخت پوست احتمالاً در مناطق مورد مطالعه، جمعیت های مستقل ژنتیکی می باشند.

نویسندگان

سمیرا وحیدی نژاد

دانشجوی کارشناسی ارشد تکثیر و پرورش آبزیان، گروه شیلات، دانشگاه هرمزگان

ایمان سوری نژاد

استادیار گروه شیلات، دانشگاه هرمزگان مکاتبات

سعید تمدنی جهرمی

استادیار بخش ژنتیک، پژوهشکده اکولوژی خلیج فارس و دریای عمان، هرمزگان

آرش اکبرزاده

استادیار گروه شیلات، دانشگاه هرمزگان

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Anahid T, Sajjadi MM, Kamrani E, Nazari Bajgan A. (2012). ...
  • Bruford M, Bradley D, Luikart G. (2003). DNA markers reveal ...
  • Bucklin A, Wiebe PH. (1998). Low mitochondrial diversity and small ...
  • Calo-Mata P, Pascoal A, Fernandez I, Bohme K, Gallardo J. ...
  • Hamzeh MA, Boumeri M, Rezaei H, Baskaleh GR (2011). Environmentl ...
  • Harris RR, Santos MCF (2000). Heavy metal contamination and physiological ...
  • Kimura M. (1980). A simple method for estimating evolutionary rate ...
  • Nei M. (1978). Estimation of average heterozygosity and Genetic distance ...
  • Ogonowski M, Hansson S, Duberg J. (2013). Status and vertical ...
  • Palumbi S, Martin RA, Romano S, McMillan WO, Stice L, ...
  • Remerie T, Vierstraete A, Weekers PHH, Vanfleteren JR, Vanreusel A ...
  • Rozas J, Sanchez-Del? arrio JC, Messeguer X, Rozas R. (2003). ...
  • Slatkin M, Hudson R. (1991). Pairwise comparisons of mitochondril DNA ...
  • Stamatis C, Triantafyllidis A, Moutou KA, Mamuris Z. (2004). Mitochondril ...
  • Thompson JD, Gibson TJ, Plewniak F, Jeanmougin F, Higgins DG. ...
  • Wang H, Kesinger JW, Zhou Q, Matrin G, Turner S. ...
  • Woods MC, Valentino F (2003). Frozen mysids _ _ alternative ...
  • Wright S. (1978). Evolution and the genetics of populations variability ...
  • Zardoya R, Castilho R, Grande C, Favre-Krey L, Caetano S, ...
  • M.Sc. student of Fisheries Department, University of Hormozgan ...
  • Assist. Professor of Fisheries Department, University of Hormozgan ...
  • Assist. Professor of Genetics Department, Persian Gulf and Oman Sea ...
  • نمایش کامل مراجع