توسعه نشانگرهای REMAPجهت بررسی تنوع ژنتیکی در جمعیت های کتان وحشی (Linum Album) ایران

  • سال انتشار: 1392
  • محل انتشار: دومین همایش ملی تغییر اقلیم و تاثیر آن بر کشاورزی و محیط زیست
  • کد COI اختصاصی: NCCCIAE02_271
  • زبان مقاله: فارسی
  • تعداد مشاهده: 598
دانلود فایل این مقاله

نویسندگان

حسین عباسی هولاسو

دانشجوی کارشناسی ارشد اصلاح نباتات دانشگاه ارومیه

بابک عبدالهی مندولکانی

استادیار گروه زراعت و اصلاح نباتات دانشگاه ارومیه

مراد جعفری

استادیار گروه زراعت و اصلاح نباتات دانشگاه ارومیه

ایرج برنوسی

دانشیار گروه زراعت واصلاح نباتات دانشگاه ارومیه

چکیده

چند شکلی حاصل از تکثیر نواحی بین توالیهای ریزماهواره و رتروترنسپوزون (REMAP) از نشانگرهای مبتنی بر PCR ساده و جدیدی است که مناطق رتروترنسپوزونی و ریزماهوارهای را مورد هدف قرار میدهد. در این مطالعه به منظور توسعه نشانگرهای رتروترنسپوزونی REMAP جهت مطالعه تنوع ژنتیکی در کتان زراعی و وحشی، 10 ترکیب آغازگری REMAP حاصل از خانواده های رتروترنسیونی LTR1868 ، LTR1854 ، LTR1833 و LTR1886 و توالیهای ریزماهواره برای ارزیابی تنوع ژنتیکی درون و بین جمعیتی 4 جمعیت (30 فرد) کتان وحشی مورد استفاده قرار گرفت. 4 ترکیب آغازگری مکان های چندشکل و قابل نمره دهی تولید کردند. در کل با استفاده از 4 ترکیب آغازگری REMAP؛44 مکان تکثیر شد که 31 مکان چندشکل بودند. تجزیه کلاستر با روش UPGMA و با استفاده از فاصله ژنتیکی دایس جمعیتها را به دو گروه تقسیم کرد. فاصله ژنتیکی بین جمعیتها از 0/008 (شاهیندژ و هولاسو) تا 0/597 (مهاباد و خوی) متغیر بود. نتایج حاصله نشان داد که نشانگرهای REMAP توسعه یافته بر اساس رتروترنسپوزونهای فعال در جنس linum می توانند به عنوان ابزار نسبتا جدیدی در مطالعه تنوع ژنتیکی و سایر زمینه های مرتبط در کتان و حتی سایر گونه های گیاهی استفاده شوند.

کلیدواژه ها

؛REMAP، رتروترنسپوزونهای فعال، linum

مقالات مرتبط جدید

اطلاعات بیشتر در مورد COI

COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.

کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.