مطالعه درون رایانه ای فاکتورهای رونویسی موثر بر تنظیم رونویسی ژن کلیدی استیل کو آ کربوکسیلاز دخیل در بیوسنتز متابولیتهای ثانویه در فاطمه امیدی سانجود، لیلا زرندی میاندوآب Dunaliella salina

  • سال انتشار: 1404
  • محل انتشار: سومین همایش ملی گیاهان دارویی، کارآفرینی و تجاری سازی
  • کد COI اختصاصی: MPEC03_093
  • زبان مقاله: فارسی
  • تعداد مشاهده: 34
دانلود فایل این مقاله

نویسندگان

فاطمه امیدی سانجود

گروه زیست شناسی، دانشکده علوم پایه، دانشگاه شهید مدنی آذربایجان، تبریز، ایران

لیلا زرندی میاندوآب

گروه زیست شناسی، دانشکده علوم پایه، دانشگاه شهید مدنی آذربایجان، تبریز، ایران

چکیده

استیل کوآنزیم آ (Acetyl-CoA) یکی از مولکولهای مرکزی در متابولیسم سلولی و پیش ساز کلیدی در سنتز متابولیتهای ثانویه محسوب می شود. آنزیم استیل کوآ کربوکسیلاز (ACC) با تبدیل Acetyl-CoA به Malonyl-CoA نخستین گام در مسیر بیوسنتز اسیدهای چرب و سایر ترکیبات ثانویه را کنترل می کند و به عنوان نقطه تنظیمی مهم در این مسیر شناخته می شود. با توجه به اهمیت تنظیم بیان ژن ACC در تولید ترکیبات زیستی ارزشمند، هدف این پژوهش شناسایی فاکتورهای رونویسی موثر بر تنظیم این ژن در ریز جلبک Dualiella salina بود. به منظور دستیابی به این هدف، ابتدا توالی ژن ACC و ناحیه پروموتر آن استخراج شد. سپس با استفاده از نرم افزار MEME Suite، و موتیف های تنظیمی احتمالی در ناحیه پروموتر شناسایی گردید. این موتیف ها با پایگاه های داده JASPAR PlantTFDB مقایسه شدند تا فاکتورهای رونویسی احتمالی تعیین شوند. نتایج حاصل نشان داد که خانواده های فاکتورهای رونویسی MYB و bZIP نقش مهمی در تنظیم ژن ACC دارند و احتمالا در پاسخ به تنش های محیطی مانند، خشکی، دمای بالا، سرما و استرس اکسیداتیو دخیل هستند. این یافته ها پایه ای برای راهبردهای مهندسی متابولیک در جهت افزایش تولید متابولیتهای ثانویه در D. salina فراهم می سازد و لزوم انجام مطالعات تجربی بیشتر برای تایید این نتایج را نشان می دهد.

کلیدواژه ها

استیل, کوآ, بیوانفورماتیک, Acetyl-CoA carboxylase, Dunaliella salina, فاکتور رونویسی

مقالات مرتبط جدید

اطلاعات بیشتر در مورد COI

COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.

کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.