بررسی تفاوت بیان ژنها تحت تنش خشکی در ریشه و برگ گیاه سویا از طریق دادههای ESTs با استفاده از Digital Differential Display

سال انتشار: 1392
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 595

فایل این مقاله در 5 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

این مقاله در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

NCPAS01_045

تاریخ نمایه سازی: 27 فروردین 1393

چکیده مقاله:

سویا یکی از دانههای روغنی مهم در دنیا میباشد، همچنین منبع عمده پروتیین خوراکی است. عملکرد سویا تحت تنش خشکی به شدت کاهش مییابد. بررسیهای ژنتیکی و مطالعه بیان ژنوم، تشخیص ژنهای کلیدی که تحمل به خشکی را تنظیم مینمایند امکانپذیر میسازد. در این مطالعه به بررسی ژنهایdownregulate و upregulateشده تحت تنش خشکی در گیاه سویا رقم Williams 82 با استفاده از داده هایESTsبه کمک روشDDD در برگ و ریشه پرداخته شد. بدین منظور یک کتابخانهEST مربوط به تنش خشکی در برگ، یک کتابخانهESTمربوط به حالت نرمال در برگ، یک کتابخانهESTمربوط به تنش خشکی در ریشه و یک کتابخانهESTمربوط حالت نرمال در ریشه با یکدیگر مقایسه شدند. نتایج نشان داد ژنهایی مانند 28 kDa protein Dehydrin-like - Sieve element occlusion s (SEOS) -Maturation-associated protein (MAT9) - (VSPA) -Lectin (LOC732576), mRNA - Probable glutathione S-transferase (HSP26-A)- protein (LOC547842وMaturation polypeptide (GMPM و ( 1 Maturation-associated protein (MAT1) در برگ هنگام تنش خشکیupregulatشدند در حالیکه ژنهایCalvin cycle protein CP12-like -Chlorophyll a/b-binding protein (cab3وMetallothionein type 1 (MET1) -(LOC100814289در برگ هنگام تنش خشکیdownregulate شدند. در ریشه ژنهای Transcribed locus, strongly similar to XP_003533862.1 -Chlorophyll a/b-binding protein (cab3وLipoxygenase -PREDICTED: repetitive proline-rich cell wall protein 1-like isoform 1 [Glycine max] Sali5-4a protein - Sali3-2 (LOC547898) - Hydroxyproline-rich glycoprotein (sbHRGP2) -(LOC547836وdownregulate PIP2,2 (LOC و ( 732581 (sali5-4a شدند و هیچ ژنی نبود که در هنگام تنش خشکی در ریشهupregulate شده باشد.

کلیدواژه ها:

سویا- تنش خشکی/Digital Differential Display

نویسندگان

فرشته بیات

استادیار گروه اصلاح نباتات دانشکده کشاورزی دانشگاه خلیج فارس،

میترا وندا

دانشجوی دکتری اصلاح نباتات دانشگاه شهرکرد،

اسماعیل ابراهیمی

استادیاربخش زراعت و اصلاح نباتات دانشکده کشاورزی دانشگاه شیراز

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Bell E, Mullet JE. 1991. Lipoxygenase gene expression is modulated ...
  • Bray EA (1993) Molecular responses to water deficit. Plant Physiol ...
  • Bray EA, Bailey-Serres J and Weretilnyk E (2000) Responses to ...
  • Hagen G, Uhrhammer N, Guilfoyle TJ. 1988. Regulation of expression ...
  • Hong JC, Cheong YH, Nagao RT, Bahk JD, Cho MI, ...
  • Kang JY, Choi HI, Im MY and Kim SY (2002) ...
  • Liu G, Xu H, Zhang L, Zheng Y. 2011. Fe ...
  • Mahajan S and Tuteja N (2005) Cold, salinity and drought ...
  • Riping B, Ernst AM, Jekat SB, Nordzieke S, Reineke AR, ...
  • Seki M, Kamei A, Yamaguchi- Shinozaki K and Shinozaki K ...
  • Sharma , K.K. and Lavanya , M. (2002) Recent developments ...
  • Specht , J.E. , Hume , D.J. and Kumudim , ...
  • Staswick PE.1988. Soybean vegetative storage protein structure and gene expression. ...
  • Tanz SK, Kilian J, Johnsson C, Apel K, Small I, ...
  • Yamaguchi- Shinozaki K and Shinozaki K (2006) Transcriptional regulatory networks ...
  • نمایش کامل مراجع