شناسائی Phytophthora capsici عامل پوسیدگی طوقه و ریشه گوجه فرنگی بر اساس توالی ناحیه ITS-Rdna دراستان فارس
- سال انتشار: 1391
- محل انتشار: سومین همایش ملی علوم کشاورزی و صنایع غذایی
- کد COI اختصاصی: RCASFT03_307
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 1432
نویسندگان
عضوهیئت علمی مرکز تحقیقات کشاورزی و منابع طبیعی فارس
چکیده
از گیاهان گوجه فرنگیLycopersicon esculentum Mill)که دارای علائم زردی پژمردگی در مرحله گلدهی درقسمت هوائی و پوسیدگی وسیع روی ریشه اصلی و فرعی بود، یک گونه فیتوفترای هتروتالیک از ریشه اصلی گیاهان بطور مداوم روی محیط کشت اختصاصیPARPHدر شهرستان مرودشت استان فارس جداسازی گردید. براساس استفاده از ترکیبی ازمعیارهای ریخت شناسی،بیماریزائی و خصوصیات رشد گونه جدا شده فیتوفترا از گوجه فرنگی با مشخصاتPhytophthoracapsici Leoninمشابه بود( 1990Stamps et alاستفاده از مشخصات ریخت شناسی و خصوصیات رشد همیشه در شناسائی گونه هایPhytophthoraمشکل بوده است.این به دلیل محدود بودن این معیارها و همچنین متغیر بودن آنها در شرائط مختلف آزمایشگاهی می باشد.در این پژوهش به منظور تائید گونه شناسائی شده از توالی های ناحیهITS-rDNA و مقایسه آنبا سایر آرایه های موجود در بانک ژن استفاده گردید. دن ان، ای جدایه های گوجه فرنگی پس از کشت در محیطPDBمایع به مدت یک هفته با استفاده از کیت استخراج مطابق پروتکل شرکت سازنده استخراج گردید.نواحی توالی هایITS با استفاده از آغاز گرهای عمومی4ITS و 5 ITS تکثیر گردید. این آغاز گرها قطعه ای به اندازه تقریبی 600 جفت باز را در جدایه هایPhytophthora capsiciتکثیر که پس از خالص سازی تعیین توالی گردید.توالی های ناحیهITS-rDNAبا سایر آرایه های موجود در بانک ژن از طریق پایگاه اطلاعاتی فیتوفترا مقایسه گردیدند.نمونه های جدا شده از گوجه فرنگی در استان فارسدارای 99-100 % تشابه با کلیه توالی Phytophthora capsici بودند.استفاده از روش های مولکولی مبنی برزنجیره پلیمرازتکمیل کننده روش های مورفولوژیکی در شناسائی گونه هایPhytophthoraمحسوب می شود.کلیدواژه ها
دن ،ان، ای ریبوزومی، فیتوفترا، گوجه فرنگی، پوسیدگی ریشهمقالات مرتبط جدید
- بررسی تنوع زیستی گیاهان مرتعی ارتفاعات کبیرکوه در جنوب دره شهر (استان ایلام)
- عوامل موثر بر میزان پیچان رودخانه های خرم اباد
- ارزیابی کیفیت آب شرب گاوهای شیری در گاوداری های صنعتی حومه مشهد از نظر وجود فلزات سنگین، نیترات و سولفات
- بیو پلیمر پلی ساکاریدی برای مصارف دامپزشکی
- راهکارهای کارآمد کاهش انتشار گازهای گلخانه ای از طریق فناوری کشاورزی هوشمند
اطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.