طراحی و ارزیابی بازدارنده های موثر جدید پذیرنده های کیناز جفت شده با پروتئین های G با استفاده از روش های غربالگری مجازی
- سال انتشار: 1403
- محل انتشار: فصلنامه شیمی و مهندسی شیمی ایران، دوره: 43، شماره: 1
- کد COI اختصاصی: JR_NSMSI-43-1_003
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 81
نویسندگان
گروه شیمی، دانشگاه پیام نور، تهران، ایران
گروه شیمی، دانشگاه پیام نور، تهران، ایران
چکیده
آنزیم های پروتئین کیناز جفت شده با پذیرنده های پروتئینی نوع G جزو موثرترین آنزیم ها در بروز و ظهور چند بیماری مهم مانند بیماری های قلبی عروقی، فشارخون بالا و آلزایمر هستند. یکی از این آنزیم ها پروتئینی با کد اختصاصی ۳v۵w در بانک اطلاعاتی پروتئین ها است. مطالعه in silico بر روی برهمکنش لیگاندهای مختلف بازدارنده بر این آنزیم صورت گرفت. با استفاده از غربالگری مولکولی با روش شبیه سازی داکینگ مولکولی نتایج برهمکنش های لیگاندهای بازدارنده انتخاب شده و پروتئین هدف با محاسبه مواردی مانند انرژی اتصال لیگاندها با پروتئین هدف، بررسی برهمکنش های غیرپیوندی لیگاندها در جایگاه فعال آنزیم و تحلیل نتایج امتیازدهی داکینگ مولکولی انجام و با نتایج لیگاند بازدارنده استاندارد (پاروکستین) مقایسه شد. همچنین برای ارزیابی بهتر و انتخاب مناسب تر از میان لیگاندهای با امتیاز داکینگ بهتر خواص وابسته به جذب، توزیع، متابولیسم، دفع و سمیت (ADMET) لیگاندهای برگزیده و پاروکستین بعنوان بازدارنده استاندارد با استفاده از پلتفرم دیتا سرور ADMETLab ۲.۰ انجام شد. در نتیجه ترکیب (R۴، S۵)-۵-(۱و۳- بنزودی اوکسول-۵-ایل اوکسی متیل)-۴-(۴-فلورو فنیل) پی پیریدین -۲-اون) به عنوان لیگاند بازدارنده جدید با پتانسیل عملکرد بهتر، مقدار قدرمطلق انرژی اتصال بزرگتر و خواص فارماکوکینتیکی مناسبتر معرفی گردید.کلیدواژه ها
شبیه سازی داکینگ مولکولی, بازدارنده جدید پروتئین کیناز, غربالگری مولکولی, پاروکستین, خواص فارماکوکینتیکیاطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.