بررسی فیلوژنتیکی ژرم پلاسم های سیب با استفاده از ISSR و نرم افزار PyElph
- سال انتشار: 1391
- محل انتشار: دوازدهمین کنگره ژنتیک ایران
- کد COI اختصاصی: CIGS12_0925
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 963
نویسندگان
دانشجوی کارنشاسی ارشد ژنتیک، گروه ژنتیک، دانشکده علوم زیستی، دانشگاه شهید بهشتی، تهران، ایران
استاد ژنتیک، گروه ژنتیک، دانشکده علوم زیستی، دانشگاه شهید بهشتی، تهران، ایران
دانشجوی کارنشاسی ارشد ژنتیک، گروه ژنتیک، دانشکده علوم زیستی، دانشگاه شهید بهشتی، تهران، ایران
موسسه تحقیقات نهال و بذرکرج
چکیده
سیب (malus domestica Borkh) از نظر اقتصادی یکی از مهمترین درختان میوه در جهان است. حدود 59 گونه و 7500 رقم در سراسر دنیا شناسایی شده است. در این پژوهش، با استفاده از مارکر مولکولی ISSR، انگشت نگاری و تعیین درجه شباهت بین 6 رقم سیب بومی و تجاری، شامل رقم های شفیع آبادی، گلاب کهنز red starking, delbarstival, idared و royal gala با استفاده از 3 پرایمر UBC810, (AGC)5GG و(GA(9C توسط نرم افزار PyElph صورت گرفت. پس از انجام PCR و تهیه ژل آگارز، الکتروفورز افقی انجام شد و بعد از رنگ آمیزی با اتیدیوم بروماید، با استفاده از اشعه UV تصویر ژل به دست آمد و در نرم افزار PyElph مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفت. PyElph یک نرم افزار open source بر پایه Python (یک زبان برنامه نویسی) برای تحلیل و بررسی تصاویر ژل بوده که می تواند برای مطالعات مختلف ژنتیکی و زیست شناسی مورد استفاده قرار گیرد. درخت UPGMA حاصل از نرم افزار PyElph نشان دهنده شباهت ژنتیکی رقم های delbarstival, royal gala و red starking است، این درخت نزدیکی دو رقم گلاب کهنز و idared را نیز نشان می دهد. در احلیکه رقم شفیع آبادی با فاصله بیشتری نسبت به سایر ژنوتیپ ها قرار گرفته که نشان دهنده تفاوت بیشتر این رقم با سایر ارقام است.کلیدواژه ها
سیب، ISSR، نرم افزار PyElphمقالات مرتبط جدید
اطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.