ردیابی توالی ژن Fom2 در ارقام حساس مقاوم به نژاد 1 قارچ Fusarium oxysporum f.sp Melonis

بیماری زردی و پژمردگی آوندی یکی از بیماری های مهم خربزه می باشد. قارچ (Fusarium oxysporum f.Sp. Melonis (FOM عامل این بیماری است و از نظر بیماریزائی در چهار نژاد صفر، یک، دو و یک، دو گروه بندی می ود. در این مطالعه با توجه به حساسیت اکثر ارقام خربزه ایرانی در مقابل نزاد 1 حضور ژن Fom2 بعنوان عامل مقاومت در برابر این نژاد در سطح ژنوم ارقام افتراقی طالبی شهد شیراز (مقاوم) و خربزه مشهدی (حساس) و دو رقم محلی خاتونی و خاقانی مورد بررسی قرار گرفت. توالی گزارش شده Fom2 از بانک ژن بازیابی شد و با انجام آنالیزهای بیوانفورماتیک مناطق محافظت شده آن تعیین و جهت طراحی پرایمر بکارگرفته شد. علاوه بر پرایمرهای داخلی (PSh20-F/R) یک جفت پرایمر (PSh20.2-F/R) نیز بر اساس ابتدا و ا نتهای ژن طراحی گردید. نتایج PCR با استفاده از پرایمرها (PSh20-F/R) حضور ژن Fom2 را در ارقام مورد مطالعه تأئید نمود و به تکثیر تک باند در اندازه مورد انتظار منت شد. از آنجا که الگوی الکتروفورزی محصول PCR در ارقام مقاوم و حساس یکسان بود جهت اطمینان از حضور توالی کامل ژن در هر دو رقم از پرایمرهای PSh20.2-F/R استفاده شد و نتایج نشان داد در ه ر دو رقم توالی کامل ژن نیز قابل تکثیر است. با توجه به نتایج بدست آمده انتظار می رود تفاوت سطح مقاومت در ارقام به دلیل وجد تنوع در توالی ژن و یا در سطح بیان آنها مربوط باشد.

کلیدواژه ها:

خربزه ، ژن Fom2 ، ردیابی ژن ، بیماری زردی و پژمردگی آوندی خربزه