مطالعه پتانسیل کامل و داکینگ مولکولی برهم کنش داروهای ضدسرطان با نانوذره طلا

سال انتشار: 1399
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 278

فایل این مقاله در 10 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_BIOT-11-3_008

تاریخ نمایه سازی: 5 دی 1403

چکیده مقاله:

در این تحقیق، ابتدا ساختار سه داروی رایج ضد سرطان شامل ۶-تیو گوانین (۶-TG)، هیدروکسی اوره (NH) و بوسولفان با استفاده از محاسبات کوانتومی بهینه و انرژی ساختار بهینه شده به دست آمد، همچنین بهینه سازی ساختار نانوذره طلا نیز مورد بررسی قرار گرفته است. در نهایت به منظور بررسی چگونگی برهم کنش داروها با نانوذره، مکان های مختلف برهم کنش دارو با نانو ذره محاسبه شد و پایدارترین ساختار به منظور مطالعه بیشتر انتخاب شد. این محاسبات با استفاده از FHI-aims، که یک بسته نرم افزاری بر پایه نظریه تابعی چگالی توسعه یافته است، انجام شده اند. طول پیوند و بهترین انرژی برهم کنش در این پژوهش گزارش شده است. به منظور بررسی بهتر مکان برهم کنش ، نوع اوربیتا ل های درگیر و شکل آنها نیز نشان داده شده است. بررسی انرژی گاف نشان داد کمترین انرژی مربوط به کمپلکس نانو ذره طلا با داروی ۶-تیوگوانین است که تایید کننده پایداری شیمیایی این دارو با نانو ذره است. بررسی ها نشان داد که انرژی اتصال نانو ذره طلا با داروها به ترتیب بوسولفان، هیدروکسی اوره ، ۶-تیوگوانین است. سپس دارو و نانو ذره طلا در پایدارترین حالت ممکن ، به صورت تک تک با نرم افزار Hex ۸ به سرم آلبومین انسانی به عنوان گیرنده، داک شدند و در نهایت انرژی های اتصالی و سایر برهم کنش ها از جمله انرژی های الکترواستاتیک، واندروالسی و پیوندهای هیدروژنی بین سرم آلبومین انسانی و داروها به همراه نانو ذره طلا محاسبه شدند. مشخص شد که جایگاه فعال داک شده برای دو دارو بوسولفان و ۶-تیوگوانین یکسان است و برای داروی هیدروکسی اوره متفاوت است.

نویسندگان

فاطمه بامدادی

Department of Chemistry, Payame Noor University, Tehran, Iran.

رضا بهجت منش اردکانی

Department of Chemistry, Payame Noor University, Tehran, Iran.

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Costantino L, Boraschi D. Drug Discov Today. ۲۰۱۲;۱۷(۷-۸):۳۶۷-۳۷۸ ...
  • De Jong WH, Borm PJ. Int J Nanomedicine. ۲۰۰۸;۳(۲):۱۳۳-۱۴۹ ...
  • Dykman L, Khlebtsov N. Chem Soc Rev. ۲۰۱۲;۴۱(۶):۲۲۵۶-۲۲۸۲ ...
  • Huo S, Jin S, Ma X, Xue X, Yang K, ...
  • Sonavane G, Tomoda K, Makino K. Colloids Surf B. ۲۰۰۸;۶۶(۲):۲۷۴-۲۸۰ ...
  • Vinogradov SV, Bronich TK, Kabanov AV. Adv. ۲۰۰۲;۵۴(۱):۱۳۵-۱۴۷ ...
  • Connor EE, Mwamuka J, Gole A, Murphy CJ, Wyatt MD. ...
  • Lin C-C, Yeh Y-C, Yang C-Y, Chen C-L, Chen G-F, ...
  • Pan Yu, Neuss S, Leifert A, Fischler M, Wen F, ...
  • Welsch W, Klein C, Von Schickfus M, Hunklinger S. Anal ...
  • Anker JN, Hall WP, Lyandres O, Shah NC, Zhao J, ...
  • Gannon CJ, Patra CR, Bhattacharya R, Mukherjee P, Curley SA. ...
  • Gobin AM, Lee MH, Halas NJ, James WD, Drezek RA, ...
  • Jain RK. Annu Rev Biomed Eng. ۱۹۹۹;۱(۱):۲۴۱-۲۶۳ ...
  • Viudez AJ, Madueno R, Pineda T, Blazquez M. J Phys ...
  • Hesabi M, Behjatmanesh-Ardakani R. COMPUT THEOR CHEM. ۲۰۱۷;۱۱۱۷:۶۱-۸۰ ...
  • Sierpe R, Noyong M, Simon U, Aguayo D, Huerta J, ...
  • Wang R, Yue L, Yu Y, Zou X, Song D, ...
  • Hesabi M. Phys Chem Res. ۲۰۱۸;۶(۱):۱۱۵-۱۳۲ ...
  • Hesabi M, Behjatmanesh-Ardakani R. Appl Surf Sci. ۲۰۱۸;۴۲۷:۱۱۲-۱۲۵ ...
  • Erb N, Harms DO, Janka-Schaub G. CANCER CHEMOTH PHARM. ۱۹۹۸;۴۲(۴):۲۶۶-۲۷۲ ...
  • Krynetskaia NF, Feng JY, Krynetski EY, Garcia JV, Panetta JC, ...
  • Narukawa M, Cortado R, Hacke K, An DS, Shimizu S, ...
  • Lanzkron S, Strouse JJ, Wilson R, Beach MC, Haywood C, ...
  • Liebelt EL, Balk SJ, Faber W, Fisher JW, Hughes CL, ...
  • Meo A, Cassinerio E, Castelli R, Bignamini D, Perego L, ...
  • شهابی ج ، شاه آبادی ح ا ، علوی س ...
  • Malär R, Sjöö F, Rentsch K, Hassan M, Güngör T. ...
  • Nieto Y, Thall P, Valdez B, Andersson B, Popat U, ...
  • Schiffman K, Bensinger W, Appelbaum F, Rowley S, Lilleby K, ...
  • Iwamoto T, Hiraku Y, Oikawa S, Mizutani H, Kojima M, ...
  • Blum V, Scheffler M, Gehrke R, Hanke F, Havu P, ...
  • Kohanoff J. Electronic Structure Calculations for Solids and Molecules: Theory ...
  • Perdew JP, Burke K, Ernzerhof M. Phys Rev Lett. ۱۹۹۶;۷۷(۱۸):۳۸۶۵-۳۶۶۸ ...
  • Hamann D, Schlüter M, Chiang C. Phys Rev Lett. ۱۹۷۹;۴۳(۲۰):۱۴۹۴-۱۴۹۷ ...
  • Garrett M MDS, Goodsell, Michael E. Pique, William “Lindy” Lindstrom, ...
  • Hetényi C, Van Der Spoel D. Efficient Docking of Peptides ...
  • Hetényi C, Van Der Spoel D. Blind Docking of Drug‐Sized ...
  • نمایش کامل مراجع