پیش بینی بهترین نواحی تحریک کننده سیستم ایمنی پروتئین Vif ویروس HIV در بیماران ایرانی مبتلابه ایدز
- سال انتشار: 1401
- محل انتشار: فصلنامه زیست فناوری، دوره: 13، شماره: 3
- کد COI اختصاصی: JR_BIOT-13-3_001
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 107
نویسندگان
Shiraz HIV/AIDS Research Center, Institute of Health, Shiraz University of Medical Sciences, Shiraz, Iran
Shiraz HIV/AIDS Research Center, Institute of Health, Shiraz University of Medical Sciences, Shiraz, Iran
Shiraz HIV/AIDS Research Center, Institute of Health, Shiraz University of Medical Sciences, Shiraz, Iran
چکیده
ویروس HIV دارای حداقل شش ژن تنظیمی است که از بین آن ها پروتئین Vif می تواند تکثیر ویروس را کنترل کند . این مطالعه برای اولین بار به بررسی جهش های مهم در پروتئین VIF در توالی های مربوط به بیماران ایرانی پرداخته است و با استفاده از دانش ایمونوانفورماتیک ، مناطق ثابت این پروتئین و توالی های اپیتوپی B-Cell ، T-CELL و CTL تعیین گردید . مواد و روش ها : توالی های VIF از بانک ژنی NCBI جمع آوری گردید و از طریق نرم افزارهای بیوانفورماتیک، ساختار سوم و جایگاه های اپیتوپی B-Cell ، T-CELL و CTLآن ها پیش بینی شد و خواص آنتی ژنیک و حساسیت زایی آن ها موردمطالعه قرار گرفت . یافته ها : بیشترین شیوع جهش ها به ترتیب مربوط به جایگاه های S ۴۹ P ( ۹۰% ) و S ۱۴۰ N و N ۱۸۶ S ( ۸۰% ) بود. هم چنین دو جابه جایی باقابلیت تاثیر در قدرت اتصال پروتئین VIF به فاکتور میزبان در جایگاه های ۴۱ و۴۲ در این مطالعه معرفی شدند. سه منطقه به عنوان توالی های اپیتوپی با تحریک کنندگی بالا و حساسیت زایی کم تعیین شد که از میان آن ها ناحیه ۵-۳۲ به عنوان بهترین ناحیه برای طراحی واکسن پیشنهاد شد. نتیجه گیری: این مطالعه به عنوان اولین مطالعه از ایران با به کاربردن ابزارهای بیوانفورماتیکی یک ناحیه باقابلیت بالای تحریک سیستم های ایمنی همورال و سلولی و هم چنین کمترین خواص حساسیت زایی معرفی شد، که می تواند در مطالعات آتی در زمینه واکسن های ضد HIV مورداستفاده قرار گیرد.کلیدواژه ها
HIV, VIF, Epitopes, Bioinformatics, HIV, VIF, اپی توپ, بیوانفورماتیکاطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.