بررسی الگوی ترجیح کدونی ژن های کلیدی بیان شده در پاسخ به بیماری پوسیدگی ساقه به دنبال فعال سازی پاسخ دفاعی حاصل از عامل مهار زیستی در کلزا

و Sclerotinia sclerotiorum (Lib.) de Bary بیمارگری است که از طریق ایجاد بیماری پوسیدگی ساقه، عملکرد و کیفیت کلزا را به شدت تحت تاثیر قرار می دهد. کنترل بیماری با استفاده از روش های تناوب زراعی به دلیل دامنه میزبانی وسیع عامل بیماری و تداوم طولانی مدت ساختارهای سختینه ی قارچ در خاک، ناکارامد است. از سوی دیگر نگرانی ها در مورد کاربرد افت کش ها، امکان استفاده از روش های مهار زیستی را به عنوان یک استراتژی جایگزین برای مدیریت بیماری فراهم کرده است. با توجه به محدودیت منابع ژنتیکی شناخته شده مقاومت به این بیماری، شناسایی ژن های ضروری پاسخ دهنده به بیماری حاصل از کاربرد عامل مهار زیستی می تواند به استفاده کارآمد از منابع ژنتیکی مقاومت جهت ایجاد واریته های متحمل بیانجامد. از سوی دیگر شناخت الگوهای متنوع کدونی، اطلاعات ارزشمندی در خصوص بهینه سازی بیان ژن و کارایی تراریخته ژنتیکی ارائه می دهد. از این رو مطالعه اخیر با هدف برسی ترجیح استفاده کدونی CUB ژن های کلیدی بیان شده در پاسخ به آلودگی پوسیدگی ساقه به دنبال فعال سازی پاسخ های دفاعی حاصل از عامل مهار زیستی Pseudomonas chlororaphis PA۲۳ انجام گرفت. بدین ترتیب که CUB ژن های کلیدی توسط شاخص های نظیر GC _ENC _CAI و GC۳S با استفاده از توابع تعریف شده در نرم افزار R-Studio نسخه ۹ اندازه گیری شد. همچنین جهت شناخت عوامل تاثیرگذار بر CUB همبستگی بین شاخص های ذکر شده نیز محاسبه شد. مقادیر بالای شاخص CAI و ۰/۸-۰/۷۳ نشان از استفاده حداکثری از کدون های بهینه در ناحیه کدکننده ژن های مورد مطالعه دارد که می تواند نقش مهمی در بیان قدرتمند این ژن ها داشته باشد.

کلیدواژه ها:

پوسیدگی ساقه ، ترجیح استفاده کدونی ، کلزا ، مهار زیستی