DeepSiPPI: Enhancing Protein-Protein Interaction Prediction through Siamese Neural Networks and Sequence-to-Image Transformation
- سال انتشار: 1402
- محل انتشار: دوازدهمین همایش ملی و سومین همایش بین المللی بیوانفورماتیک
- کد COI اختصاصی: IBIS12_195
- زبان مقاله: انگلیسی
- تعداد مشاهده: 105
نویسندگان
Department of Computer Science,University of Science and Technology of Mazandaran, Behshahr, Iran
Department of Computer Science,University of Science and Technology of Mazandaran, Behshahr, Iran
چکیده
This study focuses on the analysis and prediction of Protein-Protein Interactions (PPI) withinbiological systems. We propose an innovative methodology employing a Siamese Neural Networkarchitecture with a Convolutional Neural Network (CNN) as its underlying framework. Notably, weintroduce a novel preprocessing step involving the conversion of protein sequences into images throughthe application of a robust statistical method. Subsequently, these transformed representations areutilized as input data for the Siamese Neural Network, a choice motivated by its intrinsic capacity foreffective feature extraction. The discerning ability of the Siamese Neural Network proves instrumentalin discerning subtle patterns and features crucial for the identification of protein interactions. Thepresented approach not only showcases its utility in refining interaction predictions but also underscoresthe potential for advancing the comprehension of intricate protein networks, thereby contributing to thebroader landscape of bioinformatics research .کلیدواژه ها
Protein-Protein Interaction; Siamese Neural Network; Protein Representation; Sequenceto-Image Transformation; Bioinformaticsمقالات مرتبط جدید
- تشخیص لینک مخرب با استفاده از TF-IDF و رگرسیون لجستیک
- چالشها و راهکارهای امنیتی در شبکه های بدون سرور با استفاده از فناوری بلاکچین
- Exploring Frameworks of Information Behavior and Informal Learning: A Narrative Review Across Leisure, Equity, AI, and Cross-Cultural Contexts
- Self-Directed Language Learning and Information Behavior in Leisure Time: An International Comparative Study of Duolingo Use Among Iranian and Canadian EFL Learners
- ارائه یک سیستم توصیه گر مبتنی بر پیشنهاد محصول به مشتری در فروشگاه های اینترنتی با یادگیری ماشین
اطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.