Expression data from human breast tumors and their paired normal tissues proteinprotein interaction

سال انتشار: 1402
محل انتشار: دوازدهمین همایش ملی و سومین همایش بین المللی بیوانفورماتیک
کد COI اختصاصی: IBIS12_023
زبان مقاله: انگلیسی
تعداد مشاهده: 98

نویسندگان

Department of Biology, Faculty of Sciences, Urmia University, Urmia, Iran

چکیده

Breast cancer is globally the second most prevalent form of cancer which is affectingapproximately ۲.۰۹ million women.[۱] Numerous previous studies have revealed the peroxisomeproliferator-activated receptor (PPAR) signaling pathway and the risk of cancer. However, these studieshave yielded inconsistent results due to unknown role of the PPAR signaling pathway in cancerpromotion. Hence, this study aims to investigate the PPAR signaling pathway in breast cancer. TheRNA-Seq expression of a from a breast cancer was obtained from the Gene Expression Omnibus (GEO)dataset. In the training dataset (GSE۱۵۸۵۲), we chose and analyzed it by Cytoscape and Gephi software(fig۱). These analyses were done using twenty-one genes that exhibited differential expression of thePPAR signaling pathway by enrichment analysis and some have a role in cell cycle process such asTGFB۲. Therefore, the PRAR signaling pathway may be related to breast cancer progression.[۲]The result was, collectively most of the genes are related to the PPAR signaling pathway (Table ۱).Some genes are in the cell cycle such as TGFB۲.

کلیدواژه ها

System biology; protein-protein interaction; breast cancer; tumor; gene expression

مقالات مرتبط جدید

اطلاعات بیشتر در مورد COI

COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.

کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.