شناسایی مولکولی جنس توس (Betula) براساس توالی یابی ناحیه ITS و ساختار ثانویه آن در ایران
- سال انتشار: 1393
- محل انتشار: مجله علمی تحقیقات ژنتیک و اصلاح گیاهان مرتعی و جنگلی ایران، دوره: 22، شماره: 2
- کد COI اختصاصی: JR_IJRFP-22-2_003
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 224
نویسندگان
دانشجوی کارشناسی ارشد، رشته جنگل داری، دانشگاه تربیت مدرس، نور
نویسنده مسئول مکاتبات، استادیار دانشکده منابع طبیعی دانشگاه تربیت مدرس، نور پست الکترونیک:h.yousefzadeh@ modares.ac.ir
عضو هیئت علمی پژوهشگاه علوم و تکنولوژی پیشرفته و علوم محیطی، کرمان
استادیار دانشکده منابع طبیعی دانشگاه تربیت مدرس، نور
چکیده
در این تحقیق فیلوژنی و جایگاه تاکسونومیکی توسهای ایران بر اساس توالییابی ناحیه فاصله انداز رونویسی شونده داخلی (ITS) مورد بررسی قرار گرفت. برای این منظور نمونه برگ از چهار جمعیت باقیمانده از توس در ایران جمعآوری و پس از استخراج DNA ناحیه ITS آن تکثیر و توالییابی شد. نتایج نشان داد که طول کل ناحیه ITS برای زیرجنسهای مختلف توس ۶۱۰ تا ۶۱۱ جفت باز و برای نمونههای توس ایران ۶۱۱ جفت باز بود. نمونههای توس ایران از لحاظ درصد نوکلئوتیدهای تشکیل دهنده بیشترین میزان شباهت و کمترین فاصله ژنتیکی را با گونه B. pendula نشان دادند. بر اساس تحلیل جایگاههای نوکلئوتیدی، توسهای ایران بهدلیل داشتن نوکلئوتید انحصاری T در جایگاه ۲۰۹ از سایر توسهای مورد مطالعه متمایز بود. همچنین چهار نوع ساختار ثانویه ITS۲ متمایز، برای کل گونههای مورد بررسی از جنس توس شناسایی شد. رسم درخت فیلوژنی حکایت از تک نیایی جنس توس داشت. بر این اساس گونههای مختلف جنس توس در سه گروه اصلی قرار گرفتند. توسهای ایران بههمراه گونه B. pendula در اولین شاخه گروه اول قرار گرفتند.کلیدواژه ها
فیلوژنی, توس, ITS, DNA بارکدینگ, تنوع ژنتیکیاطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.