جداسازی و مطالعه بیوانفورماتیکی ژن عامل رونویسی TbJAMYC دخیل در بیوسنتز تاکسول از سرخدار گونه ایرانی
- سال انتشار: 1397
- محل انتشار: مجله علمی تحقیقات ژنتیک و اصلاح گیاهان مرتعی و جنگلی ایران، دوره: 26، شماره: 1
- کد COI اختصاصی: JR_IJRFP-26-1_002
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 101
نویسندگان
دانشجوی دکتری تخصصی بیوتکنولوژی پزشکی، گروه بیوتکنولوژی پزشکی، دانشکده پیراپزشکی، دانشگاه علوم پزشکی ایران، تهران
نویسنده مسئول مکاتبات، استادیار، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه بین المللی امام خمینی، قزوین پست الکترونیک: nayeri@alumni.ut.ac.ir
چکیده
داروی ضد سرطان تاکسول یا پاکلیتاکسل از متابولیتهای بیوسنتز شده در سرخدار (Taxus bacatta) است. تاکسول یکی از مهمترین و کاربردیترین داروهای ضد سرطان در درمان سرطان ریه است که با جلوگیری از پلیمریزاسیون میکروتوبولها مانع از تقسیم سلولی در بافتهای سرطانی میشود. عامل رونویسی JAMYC از خانواده MYC دارای موتیف متصلشونده به DNA بهنام bHLH میباشد که در سایر گونههای سرخدار شناسایی شده است. هدف از این تحقیق جداسازی و همسانهسازی ژن عامل رونویسی TbJAMYC برای اولین بار و تجزیه وتحلیل بیوانفورماتیکی آن است. در ابتدا برای بهدست آوردن گیاهچههای این گیاه رویان از دانههای این گیاه خارج و در محیط کشت MS حاوی زغال فعال و اسیداسکوربیک کشت شد. از RNA استخراج شده با کیفیت و کمیت خوب cDNA سنتز شد. ژن عامل رونویسی TbJAMYC بهوسیله PCR از cDNA و آغازگرهای اختصاصی این ژن تکثیر شد. قطعه تکثیر شده در ناقل همسانهسازی pTG ۱۹ بهروش TA کلونینگ همسانهسازی و توالییابی شد. خانواده پروتئینی و دمینهای پروتئین TbJAMYC بهوسیله نرمافزار Pfam تعیین شدند. همچنین بهوسیله نرمافزار Modeller ساختار سه بعدی دمینهای متصل شونده به DNA این پروتئین تجزیه وتحلیل و مدلسازی شد. این تجزیه وتحلیلها نشان دادند که پروتئین TbJAMYC جزء عوامل رونویسی MYC حاوی دمین bHLH برای اتصال به DNA و تنظیم بیان ژنها میباشد.کلیدواژه ها
تجزیه وتحلیل بیوانفورماتیکی, تاکسول, bHLH, سرخدار, عامل رونویسی MYCاطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.