جداسازی و مطالعه بیوانفورماتیکی ژن عامل رونویسی TbJAMYC دخیل در بیوسنتز تاکسول از سرخدار گونه ایرانی

  • سال انتشار: 1397
  • محل انتشار: مجله علمی تحقیقات ژنتیک و اصلاح گیاهان مرتعی و جنگلی ایران، دوره: 26، شماره: 1
  • کد COI اختصاصی: JR_IJRFP-26-1_002
  • زبان مقاله: فارسی
  • تعداد مشاهده: 101
دانلود فایل این مقاله

نویسندگان

D. Jafari

دانشجوی دکتری تخصصی بیوتکنولوژی پزشکی، گروه بیوتکنولوژی پزشکی، دانشکده پیراپزشکی، دانشگاه علوم پزشکی ایران، تهران

F. Dehghan Nayeri

نویسنده مسئول مکاتبات، استادیار، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه بین المللی امام خمینی، قزوین پست الکترونیک: nayeri@alumni.ut.ac.ir

چکیده

داروی ضد سرطان تاکسول یا پاکلی­تاکسل از متابولیت­های بیوسنتز شده در سرخدار (Taxus bacatta) است. تاکسول یکی از مهمترین و کاربردی­ترین داروهای ضد سرطان در درمان سرطان ریه است که با جلوگیری از پلیمریزاسیون میکروتوبول­ها مانع از تقسیم سلولی در بافت­های سرطانی می­شود. عامل رونویسی JAMYC از خانواده MYC دارای موتیف متصل­شونده به DNA به‎نام bHLH می­باشد که در سایر گونه­های سرخدار شناسایی شده است. هدف از این تحقیق جداسازی و همسانه­سازی ژن عامل رونویسی TbJAMYC برای اولین بار و تجزیه وتحلیل بیوانفورماتیکی آن است. در ابتدا برای به‎دست آوردن گیاهچه­های این گیاه رویان از دانه­های این گیاه خارج و در محیط کشت MS حاوی زغال فعال و اسیداسکوربیک کشت شد. از RNA استخراج شده با کیفیت و کمیت خوب cDNA سنتز شد. ژن عامل رونویسی TbJAMYC به‎وسیله PCR از cDNA و آغازگرهای اختصاصی این ژن تکثیر شد. قطعه تکثیر شده در ناقل همسانه­سازی pTG ۱۹  به‎روش TA کلونینگ همسانه­سازی و توالی­یابی شد. خانواده پروتئینی و دمین­های پروتئین TbJAMYC به‎وسیله نرم­افزار Pfam تعیین شدند. همچنین به‎وسیله نرم­افزار Modeller ساختار سه بعدی دمین­های متصل شونده به DNA این پروتئین تجزیه وتحلیل و مدل­سازی شد. این تجزیه وتحلیل‎ها نشان دادند که پروتئین TbJAMYC جزء عوامل رونویسی MYC حاوی دمین bHLH برای اتصال به DNA و تنظیم بیان ژن­ها می­باشد.

کلیدواژه ها

تجزیه وتحلیل‎ بیوانفورماتیکی, تاکسول, bHLH, سرخدار, عامل رونویسی MYC

اطلاعات بیشتر در مورد COI

COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.

کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.