مطالعه روابط فیلوژنتیکی گونه های مختلف مرزه (Satureja spp) بر اساس ناحیه هسته ای ITS و ژن کلروپلاستی matK

  • سال انتشار: 1399
  • محل انتشار: مجله علمی تحقیقات ژنتیک و اصلاح گیاهان مرتعی و جنگلی ایران، دوره: 28، شماره: 2
  • کد COI اختصاصی: JR_IJRFP-28-2_001
  • زبان مقاله: فارسی
  • تعداد مشاهده: 94
دانلود فایل این مقاله

نویسندگان

F. Noormand Moaied

Ph.D graduated, College of Agriculture and Natural Resources, University of Tehran. I.R. Iran

M.R. Bihamta

Corresponding Author. Prof., College of Agriculture and Natural Resources, University of Tehran. I.R. Iran. Email: pomato۱۹۶۰@gmail.com.

S.R. Tabaei-Aghdaei

Professor, Research Institute of Forests and Rangelands. Agricultural Research, Education and Extension Organization (AREEO), Tehran, Iran.

M.R. Naghavi

Professor, College of Agriculture and Natural Resources, University of Tehran. Iran.

چکیده

مطالعه فیلوژنی مرزه (Satureja spp.) با نام معمول Savory، با داشتن گونه های مختلف و ترکیبات با ارزشی همانند تیمول و کارواکرول، اهمیت خاصی در گیاهان دارویی دارد. در این پژوهش، ۲۱ اکسشن مرزه در قالب نه گونه از رویشگاه اصلی در هشت استان ایران شامل آذربایجان شرقی، کردستان، گیلان، خراسان شمالی، یزد، لرستان، ایلام و کرمانشاه شناسایی و جمع آوری شدند. استخراج DNA ژنومی به روش CTAB تغییریافته انجام شد. در بررسی فیلوژنی، علاوه بر نه گونه جمع آوری شده از جنس Satureja، توالی ژن های ITS و matK گونه هایی که در NCBI ثبت شده اند نیز به عنوان درون گروه به درخت فیلوژنی اضافه شد. علاوه بر جنس Satureja، توالی جنس های Thymus ،Ziziphora  و Clinopodium نیز از NCBI به عنوان برون گروه برای ریشه دار کردن درخت فیلوژنی استفاده گردید. نتایج نشان داد که در بررسی روابط خویشاوندی جنس Satureja spp.، ژن هسته ای ITS نسبت به ژن کلروپلاستی  matKمناسب تر می باشد. در گونه های بومی ایران حداکثر فاصله ژنتیکی بین گونه های S. mutica و S. atropatana و حداقل فاصله ژنتیکی بین گونه هایS. rechingeriوS. khuzistanicaبود. در درخت فیلوژنی، پنج گونه S. macrantha,  ، S. sahendica, S. atropatana, S. edmondi, S. bachtiaricaبا ارزش حمایتی ۱۰۰٪، دو گونه S. mutica, S. spicigera با ارزش حمایتی ۹۶٪ و دو گونه S. rechingeri, S. khuzistanica با ارزش حمایتی ۱۰۰٪ خویشاوند نزدیک بودند. نتایج حاصل همخوانی قابل توجهی با فلور ایران و فلور ایرانیکا از لحاظ صفات مورفولوژیکی نشان داد.

کلیدواژه ها

phylogeny, Nuclear ITS region, Satureja, Genetic distance, Chloroplast matK gene

اطلاعات بیشتر در مورد COI

COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.

کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.