کارایی نشانگرهای مولکولی RAPD و SCOT در تمایز جمعیت های خارشتر (Alhagi maurorum)
- سال انتشار: 1401
- محل انتشار: مجله علمی تحقیقات ژنتیک و اصلاح گیاهان مرتعی و جنگلی ایران، دوره: 30، شماره: 1
- کد COI اختصاصی: JR_IJRFP-30-1_002
- زبان مقاله: فارسی
- تعداد مشاهده: 72
نویسندگان
Assoc. Prof., Department of Agronomy and Plant Breeding, Faculty of Agriculture, University of Birjand, Birjand, I. R. Iran
M.Sc. Graduated of plant breeding, Department of Agronomy and Plant Breeding, Faculty of Agriculture, University of Birjand, Birjand, I.R. Iran
Assist. Prof., Department of Agronomy and Plant Breeding, Faculty of Agriculture, University of Birjand, Birjand, I.R. Iran.
چکیده
بررسی تنوع ژنتیکی اهمیت ویژه ای دردرک چگونگی ایجاد جمعیت ها در طول زمان و مکان های جغرافیایی دارند. در این تحقیق تنوع ژنتیکی ۲۲ جمعیت خارشتر (Alhagi maurorum) با استفاده از ۲۷ آغازگر RAPD و ۲۴ آغازگر SCOT طی سال های ۹۸-۱۳۹۷ مورد مطالعه قرار گرفت. از ۲۷ آغازگر RAPD، ۱۹ و از ۲۴ آغازگر SCOT، ۱۸ آغازگر چندشکلی بالایی نشان دادند. در مجموع آغازگرهای RAPD، ۱۰۰ درصد چندشکلی و آغازگرهای SCOT، ۴۲/۹۵ درصد چندشکلی نشان دادند. بالاترین شاخص محتوای اطلاعات چندشکلی را آغازگرهای R۳ و R۱۱ (۴۲/۰) و S۱۲ (۴۴/۰)، بالاترین شاخص نسبت چندشکلی (EMR) را آغازگرهای R۱۰ (۱۷) و S۲، S۴،S۶ ، S۷ وS۱۰ (۱۳)، بالاترین شاخص نشانگری (MI) را آغازگرهای R۱۳ (۹۲/۵) و S۷ (۳۶/۵) و بالاترین شاخص قدرت تفکیک (RP) را آغازگرهای R۴ (۵۴/۹) و S۱۴ (۷/۱۱) به خود اختصاص دادند. نتایج تجزیه واریانس مولکولی نشان داد که در هر دو نشانگر ۱۴ درصد از تغییرات مربوط به بین گروه ها و ۸۶ درصد مربوطه به درون گروه ها بود. تجزیه خوشه ای بر اساس داده های نشانگر RAPD، جمعیت ها را در سه و بر اساس نشانگر SCOT، جمعیت ها را در شش خوشه گروه بندی نمود. بررسی خوشه ها نشان داد که تنوع ژنتیکی از تنوع جغرافیایی تبعیت نمی کند و پیشنهاد می شود که در مطالعات آتی از تلاقی بین جمعیت تهران با جمعیت های گناباد، طبس، بشرویه، سربیشه و نیلشهر که فاصله ژنتیکی بیشتری دارند، جهت ایجاد دورگ های برتر استفاده شود. کلیه پارامترهای ژنتیکی در هر دو نشانگر تقریبا برابر و بر این اساس کارایی هر دو نشانگر در مطالعه کنونی تقریبا یکسان بود.کلیدواژه ها
cluster analysis, Gene flow, Heterozygosity, Polymorphism, Shannon indexاطلاعات بیشتر در مورد COI
COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.
کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.