DNA groove binding of an asymmetric cationic porphyrin and its Cu(II) complex: Resolved by spectroscopic, viscometric and molecular docking studies

  • سال انتشار: 1398
  • محل انتشار: مجله شیمی کاربردی روز، دوره: 14، شماره: 53
  • کد COI اختصاصی: JR_CHEM-14-53_008
  • زبان مقاله: فارسی
  • تعداد مشاهده: 105
دانلود فایل این مقاله

نویسندگان

Roghayeh Aleeshah

گروه شیمی معدنی، دانشکده شیمی، دانشگاه مازندران

Abbas Eslami

مدیر گروه، گروه شیمی معدنی، دانشکده شیمی، دانشگاه مازندران، بابلسر

چکیده

In the present study, the interaction between water-soluble cationic asymmetric porphyrin, ۵-(۱-Hexadecyl pyridinium-۴-yl)-۱۰, ۱۵, ۲۰-tris (۱-Butyl pyridinium-۴-yl) Porphyrin Chloride, and its copper (II) derivative with calf thymus DNA (CT-DNA) were studied by means of spectroscopic techniques, viscosity measurements and molecular docking. The monitoring of the changes in visible absorbance spectra showed a small red shift and a little hypochromicity in the Soret band. Also, insignificant changes were appeared in the viscosity of DNA with increasing of the porphyrins. These results suggested that these porphyrins bound to DNA through the groove binding mode. Then, multivariate curve resolution-alternating least squares (MCR-ALS) method was employed on UV–visible spectral data matrix to resolve the spectral and concentration profiles of the components involved in the interaction and the binding constant was estimated by the combination of bard equation and MCR-ALS approach. Furthermore, molecular docking studies confirmed experimental results obtained by spectral techniques and provide deeper insight into the porphyrin-DNA interaction.

کلیدواژه ها

Calf thymus DNA, Asymmetric cationic porphyrin, Grove binding mode, MCR-ALS, Molecular docking

اطلاعات بیشتر در مورد COI

COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.

کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.