بررسی ژنوتیپ ویروس بیماری نیوکاسل دخیل در سه گله گوشتی شهرستان گرمسار با استفاده از سکانس ژن F

مقدمه: یکی از شایع ترین بیماری ها در صنعت طیور نیوکاسل می باشد. در ایران بیماری نیوکاسل برای اولین بار در سال ۱۳۲۹ به طور دقیق و آزمایشگاهی تشخیص داده شد. از این رو بیماری طی مدت کوتاهی در سایر استان های کشور شیوع یافت و به خوبی در ایران مستﻘر گردید. به طوری که از آن هنگام تاکنون این بیماری یکی از مهم ترین آفات صنعت طیور کشور به شمار می آید. روش کار: طی بررسی های صورت گرفته، اقدام به اخذ نمونه سوآب از سه گله که سابقه درگیری با ویروس نیوکاسل را داشته اند، گردید. بعد از ارسال نمونه ها با آزمایشگاه و تایید حضور ویروس نیوکاسل محصول PCR خالص شده و به منظور تعیین توالی به صورت دو طرفه به آزمایشگاه Bioneer کره جنوبی ارسال شد. تعیین توالی توسط ABI Prism BigDye Terminator Cycle sequencing Ready Reaction Kit و به روش اتوماتیک انجام گرفت. بحث و نتیجه گیری: یکی از راه های تعین حدت جدایه های ویروس نیوکاسل، بررسی  ژن  F در ناحیه شکافت می باشد (F۰تبدیل به F۱  و F۲ ). طی بررسی های انجام شده در این تحقیق، با استفاده از پرایمر های اختصاصی ژن F توسط RT-PCR  از دو گله ویروس virulent نیوکاسل جدا گردید. جدایه ها بر اساس توالی و تجزیه و تحلیل فیلوژنتیک بخشی از ژن F توسط RT-PCR مورد بررسی قرار گرفتند. آنالیز فیلوژنتیک با استفاده از برنامه MEGA و رسم درخت فیلوژنی با هزار بار تکرار جهت صحت درخت فیلوژنی، انجام شد. نتایج آنالیز فیلوژنتیک نیز نشان می دهد که جدایه جدا گردیده عامل بیماری نیوکاسل در فارم های گوشتی شهرستان گرمسار، ژنوتیپ VIId می باشد که توالی آنتی ژنی ژن F در جایگاه ۱۱۲ تا ۱۱۶ توالی  RRQKR  (آرژنین، آرژنین، گلوتامین، لیزین، آرژنین)و در جایگاه ۱۱۷ شاهد حضور F (فنیل آلانین) می باشیم.

کلیدواژه ها:

ژنوتیپ ، نیوکاسل ، PC