همسان سازی و بررسی ویژگی‌های فیزیکو شیمیایی و ساختاری ژن gchI کد کننده آنزیم گوانوزین تری فسفات سیکلوهیدرولاز I از گوجه‌فرنگی رقم مموری 1

فولات ها کوفاکتورهای ضروری برای انجام واکنش‌های انتقال تک کربن در همه میکروارگانیسم ها محسوب می‌شوند. یکی از آن تیم‌هایی که در فرایند تولید اسید فولیک بخش قابل توجهی دارد آنزیم GTP سیکلوهیدرولاز I است. با افزایش بیان ژن کد کننده GTP سیکلوهیدرولاز I می‌توان به گیاهان تراریخته ای دست‌یافت که دارای میزان بالاتری از این ویتامین می‌باشد. همسان سازی ژن gchI از بافت میوه گوجه‌فرنگی (Lycopersicum esculentum L. cv. Memory1) با استفاده از تکنیک واکنش زنجیره پلیمراز RT-PCR به منظور تخلیص و نگهداری ژن gchI درون فاژمید pBluescript انجام شد تا بتوان از آن مسائل تحقیقات لوله‌کشی استفاده نمود. سپس ویژگی‌های فیزیکوشیمیایی ، ساختاری و فیلوژنتیکی آن مورد بررسی قرار گرفت. چارچوب خواندنی این ژن به‌طول bp 1٬371 می‌باشد که پروتئینی با 456 اسیدآمینه را بد می‌کند. آن نیز توالی اسیدآمینه این ژن با استفاده از نرم‌افزار EditSeq نشاند که وزن ملکولی تخمین زده شده و نقطه ایزوالکتریک پیش‌بینی شده این ژن به ترتیب برابر 43/36 کیلو دالتون و 6/866 بود و ساختار سه‌بعدی پیش‌بینی شده پارتی با استفاده از ساختار کریستالی شما از گیاه آرابیدوپسیس نشان داد که این پروتئین با سایر ژن‌های بررسی شده مطابقت داشت و دارای 11 صفحه β و 12 مارپیچ α می‌باشم. بررسی‌های فیلوژنتیکی با استفاده از ژن‌های gchI از گیاهان گوجه‌فرنگی رقم میکروتوم ، گندم، جو، آرابیدوپسیس ، برنج و ذرت تشابه بین 50% 99% را نشان می داد.

کلیدواژه ها:

فولات ، گیاه گوجه‌فرنگی ، همسان سازی ، فیلوژنتیک و chi cDNA