ارزیابی قابلیت نشانگر مولکولی Chalcone Synthase (Chs) در تشخیص گونه های جنس Erysimum L. (Brassicaceae) در شمال شرق ایران

سال انتشار: 1391
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: فارسی
مشاهده: 616

متن کامل این مقاله منتشر نشده است و فقط به صورت چکیده یا چکیده مبسوط در پایگاه موجود می باشد.
توضیح: معمولا کلیه مقالاتی که کمتر از ۵ صفحه باشند در پایگاه سیویلیکا اصل مقاله (فول تکست) محسوب نمی شوند و فقط کاربران عضو بدون کسر اعتبار می توانند فایل آنها را دریافت نمایند.

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

AGRIBIOTECH03_339

تاریخ نمایه سازی: 27 تیر 1392

چکیده مقاله:

؛ DNA بارکدینگ روش تشخیصی است که با استفاده از یک نشانگر مولکولی می توان گونه ها را به سرعت و با دقت فراوان از یکدیگر متمایز نمود. از رایج ترین توالی های مورد استفاده در DNA بارکدینگ گیاهی می توان به توالی ژنهای کلروپلاستی و ITS ریبوزومی اشاره نمود. در استفاده از این توالیها، بدلیل وراثت تک والدی )ژنهای کلروپلاستی( و پدیده تکامل هماهنگ concerted evolution ( ITS ریبوزومی( باید احتیاط لازم را مبذول داشت. در فلورا ایرنیکا از جنس Erysimum )تیره شب بو(، 5 گونه E. aitchisonii ، E. crassicaule ، E. ischnostylum ، E. persepolitanum و E. stocksianum ا ز استانهای خراسان گزارش شده است. در این تحقیق، از نشانگر هسته ای و تک نسخه ای Chalcone Synthase (Chs) برای یافتن مرز بین این 5 گونه و تمایز آنها از یکدیگر استفاده شده است. ابتدا DNA ژنومی گونه های فوق الذکر به روش CTAB استخراج شد. با کمک توالیهای ژن Chs جنس Erysimum و برخی دیگر از جنسهای تیره شب بو موجود در بانک ژن، دو آغازگر )رفت و برگشت( مناسب طراحی شد. با کمک آغازگرها، توالی ژن فوق با استفاده از واکنش زنجیره ای پلیمراز ) PCR ( تکثیر شد. توالیها پس از همردیف سازی با نرم افزار BioEdit ، توسط نرم افزار MrBayes مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفتند. نتایج نشان می دهد که نشانگر Chs می تواند بعنوان بارکد مناسبی برای جداسازی گونه های Erysimum بکار گرفته شود.

نویسندگان

جمیل واعظی

استادیار گروه زیست شناسی، دانشکده علوم، دانشگاه شهید چمران اهواز

سمیه قائم پناه

دانشجوی کارشناسی ارشد گروه زیست شناسی، دانشکده علوم، دانشگاه فردوسی

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Doyle, J. J., Doyle, J. L., 1987. A rapid DNA ...
  • Hall, T. A., 1999. BioEdit A user-friendly biological sequence alignment ...
  • Huelsenbeck, J. P., Ronquist, F., 2001. MRBAYES: Bayesian inference of ...
  • Khosravi, A. R., Mohsenzadeh, S., Mummenhoff, K, 2009. Phylogenetic relationships ...
  • Koch, M. A, Al-Shehbaz, I. A, 2008. Molecular systematics and ...
  • Polatschek, A., Rechinger, K. H., 1968. Erysimum (Cruciferae). In: Rechinger ...
  • Rambaut, A, Drummond, A.J., 2003. Tracer v 1.3. Available from: ...
  • نمایش کامل مراجع