ردیابی و شناسایی پوسیدگی فیتوفتورایی ریشه و طوقه درختان گردو با استفاده از آغازگرهای اختصاصی

  • سال انتشار: 1391
  • محل انتشار: سومین همایش ملی بیوتکنولوژی کشاورزی ایران (گیاهی، دامی و صنعتی)
  • کد COI اختصاصی: AGRIBIOTECH03_242
  • زبان مقاله: فارسی
  • تعداد مشاهده: 1245
دانلود فایل این مقاله

نویسندگان

حسین علایی

عصر گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه ولی (عج) رفسنجان،

نجمه رفعتی

گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر کرمان

حمید محمدی

گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر کرمان

حسین معصومی

گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر کرمان

چکیده

پوسیدگی فیتوفتورایی طوقه و ریشه یکی از مهمترین بیماریهای خاک برد درختان گردو در ایران و جهان میباشد که منجر به خشیکدگی سرشاخه و مرگ درخت میشود. از این رو تشخیص به موقع بیماری نقش مهمی در مدیریت موثر این بیماری دارد. به همین منظور شناسایی و ردیابی مولکولی عامل بیماری از منابع آلوده بر اساس تکثیر قطعهی اختصاصی از ناحیه rDNA-IT طراحی آغازگرهای اختصاصی انجام شد. طی سالهای 1388 تا 1390 از باغات گردوی سیرجان و بافت نمونهبرداری شد. با استفاده از محیط کشت انتخابی تعداد 35 جدایه فیتوفتورا جداسازی شد. بر اساس ویژگیهای ریخت شناختی و مولکولی گونه های P. cactorum ، Phytophthora citrophthora و P. citricola شناسایی شد که گونه P. citricola نسبت به دو گونه دیگر با سرعت بیشتری قادر به آلودگی بود. حساسیت و اختصاصیت جفت آغازگرها به ترتیب با استفاده از گونههای هدف و 27 گونه از فیتوفتورا و قارچهای خاکبرد بررسی شد. نتایج نشان داد جفت آغازگرهای PciF248/PciR 249 و PcaF246/PcaR 247 به ترتیب برای ردیابی P. citricola و P. cactorum بسیار اختصاصی هستند بطوریکه به ترتیب قطعه 109 و 102 جفت بازی در PCR معمولی تکثیر شد. درحالیکه هیچ باندی همراه با DNA سایر گونههای خاک برد تکثیر نشد. حساسیت جفت آغازگر، در ردیابی بیمارگر هدف با استفاده از PCR معمولی 20pg از DNA خالص بیمارگر بود. حساسیت آغازگرها در ردیابی بیمارگر از بافت، خاک وآب آلوده در حال بررسی است. به هر حال در ارزیابی اولیه، این روش ردیابی، بسیار دقیق و حساس میباشد و میتواند برای تشخیص بیمارگر و همچنین بخشی از برنامه کنترل این بیماری مورد استفاده قرار گیرد.

کلیدواژه ها

، ردیابی P. citricola ،Phytophthora cactorum ، گردو، پوسیدگی ریشه و طوقه

مقالات مرتبط جدید

اطلاعات بیشتر در مورد COI

COI مخفف عبارت CIVILICA Object Identifier به معنی شناسه سیویلیکا برای اسناد است. COI کدی است که مطابق محل انتشار، به مقالات کنفرانسها و ژورنالهای داخل کشور به هنگام نمایه سازی بر روی پایگاه استنادی سیویلیکا اختصاص می یابد.

کد COI به مفهوم کد ملی اسناد نمایه شده در سیویلیکا است و کدی یکتا و ثابت است و به همین دلیل همواره قابلیت استناد و پیگیری دارد.